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DNA复制,即DNA生物合成,是以碱基互补为基础的一个严格的脱氧核苷酸分子逻辑组合的过程,对真核细胞来说,它发生在细胞周期的S期。揭示DNA复制的奥秘,起初是从原核细胞开始的,从中积累了丰富的实验依据,发现DNA复制的规律。随后的研究进一步证明,真核生物DNA复制的过程与原核生物基本相似。因此,本节主要叙述的是原核生物DNA复制过程。
DNA复制基本上可分为解链、引发、延长及终止四个阶段。
一、DNA复制的一般特点
1.DNA的双螺旋的两条链在局部需要解开,以利于每条链作模板。
2.DNA的局部解旋引起周围区域过度缠绕,拓朴异构酶使超螺张力释放.
3.DNA聚合酶以5`到3`方向合成。DNA的两条链方向相反,因此,,一条链的合成是连续的,而另一条链的合成则是不连续的。不连续链每个片段的合成都是独立进行的,然后各片段再连接起来。
4.DNA复制必须高度精确,DNA复制错误率大约是1/1010,校正机制保证新合成的NA的正确性。
5.DNA的合成必须非常迅速,其合成速度与基因组的大小及细胞分裂速度有关。
6.复制器本身不能复制线性DNA的末端,一种特殊的端粒酶参与端粒的复制。
二、复制的起始
DNA复制的起始阶段,由下列两步构成。
(一)预引发:
1.解旋解链,形成复制叉由拓扑异构酶和解链酶作用,使DNA的超螺旋及双螺旋结构解开,碱基间氢键断裂,形成两条单链DNA。单链DNA结合蛋白(SSB)结合在两条单链DNA上,形成复制叉。
图10-21复制叉的三维作用结构
(二)引发体组装:
由蛋白因子(如dnaB等)识别复制起始点,并与其他蛋白因子以及引物酶一起组装形成引发体。
图10-22引发体形成
1.dnaA结合于复制起始点(oric)
2.dnaA与DNA形成复合物引起DNA的解链
3.dnaA在dnaC的辅助下推动DNA双链解开
三、复制的延长
(一)聚合子代DNA:
1.需要引物参与DNA复制的DNA聚合酶,必须以一段具有3’端自由羟基(3’-OH)的RNA作为引物(primer),才能开始聚合子代DNA链。RNA引物的大小,在原核生物中通常为50~100个核苷酸,而在真核生物中约为10个核苷酸。RNA引物的碱基顺序,与其模板DNA的碱基顺序相配对。
2.引发体移动:引发体向前移动,解开新的局部双螺旋,形成新的复制叉,随从链重新合成RNA引物,继续进行链的延长。
3.延长DNA链的合成开始于RNA引物的3'-OH端,由DNA聚合酶催化,以3→5方向的亲代DNA链为模板,按碱基互补规律,利用四种脱氧核苷三磷酸,以5'→3'方向逐个加入脱氧核苷酸,聚合形成与模板链相互补的DNA新链。在合成过程中,前导链连续合成,随后链形成冈崎片段。原核生物两个聚合酶III结合在一起,尾随链形成环,才能穿过复合物。两条链在一个位置上合成。
图10-22DNA链的延伸过程
(二)DNA复制的保真性:
为了保证遗传的稳定,DNA的复制必须具有高保真性。DNA复制时的保真性主要与下列因素有关:
1.遵守严格的碱基配对规律;
2.DNA聚合酶在复制时对碱基的正确选择;DNA-polⅢ可选择参入的核苷酸,检查配对碱基间氢键的正确搭配形成,保证加入碱基与模板碱基严格互补,以控制合成前的错误。
3.对复制过程中出现的错误及时进行校正。当检出错配碱基时,DNA-poiI的3,一5,外切活性可切除新合成的错配、移码、插入的错误核苷酸,并聚合补回正确配对的碱基,这种方式叫即时校读(proofread)。
四、复制的终止
从E.coliDNA复制显示,其复制的终止发生在距离复制起始点oriC约270Kb区的中心,称为终止区(terminationregion,ter)。在此区中包含有5个ter序列,其核心序列为GTGTGGTGT,它们可以和Tus蛋白结合,阻止解链酶的作用,导致复制的终止。有一些原核生物复制的起始点和终止点刚好把环形DNA分为两个半圆,双相复制朝两个方向各进行180°,同时在终止点汇合。
(一)去除引物,填补缺口:
在原核生物中,由DNA聚合酶Ⅰ来水解去除RNA引物,并由该酶催化延长引物缺口处的DNA,直到剩下最后一个磷酸酯键的缺口。而在真核生物中,RNA引物的去除,由一种特殊的核酸酶来水解,而冈崎片段仍由DNA聚合酶来延长。
图10-23RNA引物通过PolI5’?3’外切酶活性除去并填补空缺
(二)连接冈崎片段:
在DNA连接酶的催化下,形成最后一个磷酸酯键,将冈崎片段连接起来,形成完整的DNA长链。
复制中的不连续片段在合成终止时完成了下列过程:
1、需先由RNA酶水解引物,
2、引物留下的空隙(gap)由DNA聚合酶I催化dNTP逐一自5′向3′端聚合而填补。
3、两不连
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