LAMP微流控芯片即时检测骨髓增殖性肿瘤分子标志物.ppt

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第二部分研究工作3D示意图研究方法与结果-聚丙烯丝束/毛细管提取基因组DNAQubit定量5μl全血:50±2.5ng;10μl全血:81±4.2ng;20μl全血150±5.8ng15分钟内完成采血、基因组DNA提取基因组DNA具有完整性授权专利:一种快速提取全血基因组DNA的装置(ZL201510532629.5)研究方法与结果-便携式微型温控仪温控仪设计图温控仪实物图温控仪控制温度为37~100°C,控制精度≤±0.3研究方法与结果-MPLW515K/L引物设计及验证W515k引物特异性扩增W515K突变质粒W515L引物特异性扩增W515L突变质粒可视化检测(515K引物)(515L引物)515K突变质粒515L突变质粒W515野生型引物特异性扩增W515野生型质粒研究方法与结果可视化检测515野生型引物515野生型质粒研究方法与结果-MPLW515K/L引物设计及验证实时浊度法W515k引物特异性扩增W515K突变质粒W515L引物特异性扩增W515L突变质粒研究方法与结果-MPLW515K/L引物设计及验证实时浊度法W515野生型引物特异性扩增W515野生型质粒方法与结果-MPL515K/LLAMP产物测序515LTGG-TTG515KTGG-AAG方法与结果-MPL515KLAMP产物酶切鉴定方法与结果-MPL515LLAMP产物酶切鉴定设计及制作检测MPN多个分子标志物的LAMP微流控芯片μmLchip:ALAMPmicrochipforsimultaneousmulti-genemutationscreeninginpatientwithMPN)检测基因检测槽道阳性对照槽道V617F野生型1P1V617F突变型2P2W515K突变型3P3W515L突变型4P4W515野生型5P5N,阴性对照;P,阳性对照;N*,空白对照μmLchipμmLchipA,SU-8阳模;B,μmLchip实物图研究流体控制的芯片流体控制芯片A,SU-8阳模;B,芯片实物图检测基因突变率的微流控芯片灵敏度检测微流控芯片A,SU-8阳模;B,芯片实物图芯片流体控制研究矿物油阀控制LAMP芯片流体A,加热前;B,65℃加热1小时后LAMP微流控芯片检测基因突变灵敏度分析A,W515K(0.1%);B,W515L(0.1%);V617F(0.01%)方法学准确度分析本室自建方法作为参考方法非标记探针HRM分析JAK2V617F突变,荧光定量PCR分析MPLW515K/L突变临床样本:30例ET患者,10例PMF患者ET患者:12例JAK2V617F突变阳性,1例MPLW515K突变阳性(同时伴JAK2V617F突变阳性,1例MPLW515L突变阳性。PMF患者:4例JAK2V617F突变阳性,1例MPLW515L突变阳性。μmLchip与参考方法基本一致对1例未确认样本(μmLchip:JAK2V617F突变阳性;非标记探针HRM法:阴性)进行亚克隆测序,测序结果确定此标本存在JAK2V617F突变。μmLchip检测结果模式JAK2V617F突变型MPLW515K突变型MPLW515L突变型μmLchip检测结果MPL515K和JAK2V617F同时突变型第二部分小结聚丙烯丝束/毛细管国家发明专利:一种快速提取全血基因组DNA的装置和方法申请号:201510532629.5实用新型专利:一种快速提取全血基因组DNA的装置专利号:ZL201510532629.5便携式微型温控仪μmLchip:JAK2V617F、MPLW515K/L同步即时检测*我们研制了一款特殊毛细管,填充聚丙烯丝束可实现末梢血基因组DNA的快速提取,毛细管采用橡胶滴头控制流体。B为扫描电镜表征聚丙烯丝束,其表面具有多孔隙结构,采用乙醇沉淀法对末梢血基因组DNA进行提取C为毛细管从5、10和20微升全血中提取的基因组DNA凝胶电泳结果,均为50kb大小的单一条带,显示了基因组DNA良好的完整性。Qbit2.0荧光计分析,在15分钟内毛细管分别从5、10和20微升全血中提取出50、81和150ng的基因组DNA。结果显示,毛细管提取的DNA满足后续的芯片等温扩增反应。此部分工作,我们已获一项实用新型专利*下一步工作我们研制了一款便携式微型温控仪,可实时给LA

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