ITS序列分析相关的名词解释.pdf

1DNA分子标记：在DNA分子上检测生物间的差异，是DNA水平遗传变异的直接

反映。DNA分子标记能对各个发育时期的个体、各个器官甚至细胞作检测，不受

环境与基因表达与否的限制，数量极多，遍及整个基因组，多态性高，遗传稳定

DNA条形码-新的生物身份识别系统（以染色体组为基础）：利用标准的、有

足够变异的、易扩增且相对较短的DNA片段对物种进行快速、准确地自动鉴定。

与传统鉴定方法的理论基础不同，DNA条形码技术基于物种基因型的差异，而不

是环境密切相关的表现型，克服了传统鉴定方法的诸多缺陷，具有鉴定结果准确、

可重复性良好、方法通用性强等优点。还有助于发现新种和隐种。

DNA条形码的优点：1以信息稳定的DNA序列为检测对象，每一物种具有各自

特定的DNA序列信息，同种生物不同生长期具有相同的DNA序列信息，即使经过

加工使其形态发生变化，但其DNA序列信息不会改变，而传统形态学鉴定特征会

因趋同性和变异导致鉴定错误；与传统分类方法相比，DNA条形码技术矿大了检

测样本的范围，即使样本部分受损也不会影响鉴定结果。2能够抛开形态相似的

假象，从基因水平上对传统分类方法难以区分的类群进行物种鉴定。3建立DNA

条形码数据库，不但可以一次性鉴定大量物种，而且可以提供各物种的明确信息；

不仅能够弥补传统分类学对物种形态描述的不足，而且还可以加快对已知物种的

识别速度；同事有助于发现新物种。4在DNA条形码技术的基础上研制简便和高

效的条形码扫描仪，可以加快物种鉴定和进化研究的步伐，有益于推进分类学研

究基础薄弱的国家，尤其是发展中国家物种鉴定及进化研究的步伐。

传统鉴定（中药材四大传统鉴定方法：基原鉴定、性状鉴定、显微鉴定和理化

鉴定）的缺点：基原鉴定和性状鉴定难以区分形态性状相似的近缘种，且药用植

物形态性状易受地理生态环境、生长期等因素影响，从而影响鉴定结果的准确性；

理化鉴定中的活性成分易受其生理条件、采收时间的因素的影响，同时对化学成

分相似的物种也较难区分。

2ITS序列：在rDNA基因中，16SrDNA和28SrDNA基因间隔序列称为（ITS）。

非编码区

用途：在种间及种下居群间具有进化速率快，变异程度高、区分物种能力强

的特点，适用于药用植物与其近缘种类等较低分类阶元的分子鉴定。

6非转录间隔区：DNA分子中，不同基因（操纵子）之间的非转录序列

7保守序列：指DNA分子中的一个核苷酸片段或者蛋白质中的氨基酸片段，它们

在进化过程中基本保持不变。

10信息位点：信息位点就是指能由位点产生的突变数目把一棵树与其它树区分

开来的位点。信息位点是指那些至少存在2个不同核苷酸且每个不同核苷酸至少

出现两次的位点。

11系统学:是提炼系统论、信息论、控制论的共同基础理论而形成的一门学科，

建立系统科学基础科学的这种系统学是由中国学者钱学森所倡导

12指纹图谱：中药指纹图谱是指某些中药材或中药制剂经适当处理后，采用一

定的分析手段，得到的能够标示其化学特征的色谱图或光谱图。

13遗传多样性：遗传多样性又称为基因多样性。是生物多样性的重要组成部分。

同种个体间因为其生活环境的不同，经历长时间的天择、突变所产生的结果。如

果遗传多样性越高，则族群中可提供环境天择的基因愈多；相对的，对于环境适

应能力就愈强，有利于族群的生存及演化。

14RAPD技术：随机扩增多态性DNA，是一种基于PCR的分子标记。利用随机引

物对基因组DNA进行扩增，由于引物在DNA模板上的结合位点不同，所以就可以

扩增出不同长度的多态性片段，是基于全基因组水平上检测DNA变异的一种快

速、有效的技术体系。

15亲缘关系：生物类群在系统发生上所显示的某种血缘关系

17系统发育树：进化树的构建是一个统计学问题，我们所构建出来的进化树只

是对真实的进化关系的评估或者模拟。进化树由结点和进化分支组成，每一结点

表示一个分类学单元（属、种群、个体等），进化分支定义了分类单元（祖先与

后代）之间的关系，一个分支只能连接相邻的节点。进化树分支的图像称为进化

的拓扑结构，其中分支长度表示该分支进化过程中变化的程度，标有分支长度的

进化分支叫标度枝。校正后的标度树常常用年代表示，这样的树通常根据某一或

部分基因的理论分析而得出。进化分支可以没有分支长度的标注，没有被标注的

分支长度不表示变化的程度，随让分支的有些地方用数点进行了注释。无根的树

只是指明了种属的相互关系，没有确认共同祖先或进化途径。

目的：建树的目的是为了检验每个物种的单系性，即同一个物种的不同个