茅苍术的全长转录组分析.pdfVIP

第42卷第3期中南民族大学学报（自然科学版）Vol.42No.3

2023年5月JournalofSouth-CentralMinzuUniversity（NaturalScienceEdition）May2023

茅苍术的全长转录组分析

111,21*

周竹青，林敏，梅之南，熊慧

（1中南民族大学药学院，武汉430074；2华中农业大学植物科学技术学院，武汉430070）

摘要为探究茅苍术Atractylodeslancea（Thunb.）DC.中药用活性成分生物合成的遗传基础，对茅苍术进行三代

全长转录组测序，通过生物学信息学分析，构建了茅苍术全长转录本数据库.共获得26238条平均长度为1360bp的

全长转录本，其中25413条（96.86%）在NR、KEGG、GO、KOG和Swiss-Prot5个数据库中得到注释.根据NR比对结

果，茅苍术与菊科菜蓟属刺苞菜蓟（Cynaracardunculus）最为相似；根据GO注释分析，8371条转录本注释到生物学

过程、分子功能和细胞组成的三大类共48条GO条目；有15848条转录本注释到KOG数据库，参与基本功能预测序

列数目最多，为2598条；在KEGG注释分析中，共有12137条转录本被注释到130条代谢通路；基因结构分析中，得

到325条LncRNA、24723条CDS序列，检测到SSR位点8027个；根据转录因子分析，共预测到81个TF家族，包括

1830个转录因子.该研究获得了茅苍术的全长转录组数据库，并为后续开展苍术的育种、活性成分的生物合成机制

以及遗传多样性等分子研究提供宝贵的遗传资源.

关键词茅苍术；全长转录组；功能注释

中图分类号S567.239文献标志码A文章编号1672-4321（2023）03-0319-08

doi：10.20056/ki.ZNMDZK

Full-lengthtranscriptomeanalysisofAtractylodeslancea(Thunb.)DC.

111,21*

ZHOUZhuqing，LINMin，MEIZhinan，XIONGHui

（1SchoolofPharmaceuticalSciences，South-CentralMinzuUniversity，Wuhan430074，China；2CollegeofPlant

ScienceandTechnology，HuazhongAgriculturalUniversity，Wuhan430070，China）

AbstractInordertoexplorethegeneticbasisofthebiosynthesisofactivecomponentsinAtractylodes