《紫花苜蓿高通量基因型鉴定分析技术规程》.docx

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ICS65.020

B20

团体标准

T/HXCYXXX-2024

紫花苜蓿高通量基因型鉴定分析技术规程

TechnicalRegulationsforHighThroughputGenotypeIdentificationandAnalysisofAlfalfa

（征求意见稿）

2024-XX-XX发布2024-XX-XX实施

北京华夏草业产业技术创新战略联盟发布

T/THXCYxxx-xxxx

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目次

TOC\o1-1\h\u前言 I

1范围 1

2规范性引用文件 1

3术语和定义 1

4仪器与设备 3

5测定 3

6生物信息分析 4

7检测报告 6

前言

本文件按照GB/T1.1—2020《标准化工作导则第1部分：标准化文件的结构和起草规则》的规定起草。

本标准由北京华夏草业产业技术创新战略联盟提出并归口。

本文件起草单位：中国林业科学研究院生态保护与修复研究所、华智生物技术有限公司、内蒙古草业技术创新中心有限公司、内蒙古大学、中国农业科学院北京畜牧兽医研究所。

本文件主要起草人：刘希强、李晓霞、黄刚、唐顺学、刘亚玲、任卫波、马琳、仪登霞。

本文件为首次发布。

本文件的某些内容可能涉及专利。本文件的发布机构不承担识别这些专利的责任。

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紫花苜蓿高通量基因型鉴定分析技术规程

1范围

本标准规定了紫花苜蓿（MedicagosativaL.）基因型高通量鉴定的主要技术内容，包括紫花苜蓿gDNA提取与检测、cGPS测序文库构建、生物分析流程等。

紫花苜蓿高通量基因型鉴定分析基于紫花苜蓿60K液相芯片开展靶向捕获测序，能够对大规模紫花苜蓿群体开展高效、精准、低成本地基因型分型检测，基于分型结果，可在紫花苜蓿育种或辅助育种中开展应用，主要包括群体遗传主效基因选择、分子标记辅助育种定向改良、全基因组选择育种、紫花苜蓿品种真实性鉴定、遗传图谱构建、基因定位和种质资源遗传多样性评价等。

本标准适用于紫花苜蓿高通量基因型鉴定分析。

2规范性引用文件

下列文件中的内容通过文中的规范性引用而构成本文件必不可少的条款。其中，注日期的引用文件，仅该日期对应的版本适用于本文件；不注日期的引用文件，其最新版本（包括所有的修改单）适用于本文件。

GB/T30989—2014高通量基因测序技术规程

GB/T40171—2021磁珠法DNA提取纯化试剂盒检测通则

DB32/T3860—2020玉米品种及纯度鉴定技术规程SNP标记法

T/JSFT/JSF001—2024美洲黑杨性别苗期鉴定技术规程——SSR分子标记法

3术语和定义

下列术语和定义适用于本文件。

3.1基因gene

位于染色体上编码一个特定功能产物（如蛋白质或RNA分子）的一段核苷酸序列，是遗传信息的基本单位。

3.2文库library

通过生物来源、人工合成或克隆技术等得到的重建分子群，如基因组文库。

3.3探针probe

能识别特定碱基序列的、经过人工标记的一小段单链核酸分子。

3.4高通量基因测序high-throughputgenesequencing

区别于传统双脱Sanger测序，高通量测序能够一次并行对大量核酸片段序列进行大规模平行测定的技术，通常一次测序反应能产出不低于100Mb的测序数据。

3.5基因型genotype

指一个生物体内的DNA所包含的基因，也就是说该生物的细胞内所包含的、它所特有的那组基因。

3.6引物primer

在DNA复制过程中，结合于模板链上并作为复制延伸的起始位点和/或终止位点的，具有一定长度和顺序的寡核苷酸链。

3.7DNA聚合酶DNApolymerase

以一条DNA链作为模板合成一条新的DNA链时所需要的酶。

3.8DNA连接酶DNAligase

在DNA复制、修复和重组过程中，由发挥作用的催化磷酸二酯键合成的酶。

3.9SNP标记SNPmarker

是指在基因组上单个核苷酸的变异，形成的遗传标记，其数量很多，多态性丰富。

3.10液相基因芯片liquid-phasegenechip

?是通过挑选目标区域多态性高、缺失率低、分布均匀的标记位点信息作为参考设计探针，并合成特异性液相芯片，在液相环境下对目标区域序列的定向捕获富集和高通量测序。

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