《单基因遗传病临床全外显子组测序性能验证及室内质控规程》编制说明.pdf

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附件2

《单基因遗传病临床全外显子组测序性能

验证及室内质控规程(征求意见稿)》团

体标准编制说明文件

一、工作简况

(一)任务来源

2023年7月,由深圳市标准化协会批准《单基因遗传

病临床全外显子组测序性能验证及室内质控规程》立项。

本标准起草工作组由北京协和医院、浙江省人民医院、大

连市妇女儿童医疗中心(集团)、吉林大学第一医院、中

国医科大学附属盛京医院、重庆医科大学附属儿童医院、

云南省第一人民医院、深圳华大基因股份有限公司、深圳

华大医学检验实验室、安诺优达基因科技(北京)有限公

司、北京贝瑞和康医学检验实验室有限公司共同组成。

(二)编制背景、目的和意义

临床全外显子组测序指的是利用序列捕获技术将外显

子区域捕获并富集后进行高通量基因测序,针对公共数据

库(如OMIM数据库)中明确致病的基因,对获得的全外显

子组数据进行单基因遗传病相关的变异校正及解读信息注

释,从而获得与受检者相关的遗传病变异信息的检测方法。

与传统测序相比,全外显子组测序在迅速获得所有外

显子区域的遗传信息的同时,显著减低了成本,而与全基

因组测序相比,它能够在缩短周期,减少数据分析量及实

验投入的基础上有针对性的获得大部分通过全基因组测序

所获得的信息,是一种高性价比的遗传病分子诊断工具,

也是当今揭示遗传性疾病致病原因最常用的方法。cWES可

用于精确寻找遗传病疑似患者,尤其是怀疑具有遗传原因,

但临床上无法明确诊断的疑难杂症患者;也可用于寻找有

遗传病生育史的人群的致病原因,辅助临床诊断;还可以

全面、快速、准确地帮助育龄夫妇了解自身致病突变的携

带情况,提供生育指导,预防出生缺陷的发生。

据调研,目前市面上的临床全外显子组测序的整个检

测环节没有统一的质量规范,且暂无整个检测环节的国家

标准及行业标准。仅有2020年发布的《T/GDPMAA0003—

2020广东省精准医学应用学会产前外显子组测序遗传咨询

和报告规范》和2021年发布的《T/CHIA21.2—2021中国卫

生信息与健康医疗大数据学会组学样本处理与数据分析标

准第2部分:全外显子组测序数据分析》对部分应用场景下

的部分检测环节进行了相关规范的撰写。随着专家共识及

社会对单基因遗传病的关注,临床全外显子组测序的应用

越来越广泛,市场上临床全外显子组测序产品的检测整体

质量良莠不齐,急需相关标准对其进行规范统一。本标准

规范了临床全外显子组测序性能验证及室内质量控制(室

内质控)的过程,涵盖检测性能和室内质控的要求、性能

确认的过程、方法和评估要求等,旨在为检测服务提供商

及提供相关检测的各类检测机构,在开展全外显子组测序

对人类基因组进行单基因遗传病变异检测时的质量控制程

序提供规范性建议,包含但不局限于运行前性能确认及运

行中室内质控的流程及要求,覆盖范围包括但不限于实验

操作、数据分析、结果判读以及报告出具过程。适用于以

大规模并行测序技术为技术路线的单基因遗传性疾病全外

显子组测序,适用于该类型检测服务提供商及提供相关检

测的各类检测机构。

(三)主要编制过程

1.前期准备

2023年6月,深圳华大医学检验实验室开展标准编制

启动会议,对标准编制的内容范围、分工以及整体计划等

进行全面讨论。对调研资料加以整理分析,开始着手进行

标准各部分的起草工作。

2.标准立项

2023年7月28日,深圳市标准化协会批准《单基因遗

传病临床全外显子组测序性能验证及室内质控规程》的立

项。

3.编制标准草案

2024年3月20日,北京协和医院与深圳华大医学检验

实验室开展会议,对标准的整体范围与框架、性能确认流

程、预期临床用途等进行全面研讨。对调研资料加以整理

分析,由深圳华大医学检验实验室起草标准的初步框架。

2024年6月20日,由北京协和医院、浙江省人民医院、

大连市妇女儿童医疗中心(集团)、吉林大学第一医院、

中国医科大学附属盛京医院、重庆医科大学附属儿童医院、

云南省第一人民医院、深圳华大基因股份有限公司、深圳

华大医学检验实验室、安诺优达基因科技(北京)有限公

司、北京贝瑞和康医学检验实验室有限公司共同成立标准

编制小组。标准编制小组成员对标准初稿进行审阅,并针

对整体框架、标准阈值划定、规范用语、引用文件等方面

提出具体修改建议。

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