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蛋白质分子的结构层次;1-2蛋白质的一级结构;
1-3 蛋白质的二级结构
;三、?-折叠;?
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图1-11平行β折叠氢键形成和折叠图1-12反平行β折叠氢键形成和折叠
;平行和反平行混合β折叠氢键的形成
;Twists
;转角(Turn);Gammaturn.
thehydrogenbondbetweenCOofresidueiandNHofresiduei+2.Thedihedralanglesofresiduei+1are(70,-60)and(-70,60)forphiandpsioftheclassicalandinversegammaturns.;TypeIturn.
thehydrogenbondbetweenCOofresidueiandNHofresiduei+3.
Thebackbonedihedralanglesofresidueare(-60,-30)and(-90,0)ofresiduesi+1andi+2,respectivelyofthetypeIturn.Prolineisoftenfoundinpositioni+1intypeIturnsasitsphiangleisrestrictedto-60anditsimidenitrogendoesnotrequireahydrogenbond.
GlycineisfavoredinthispositioninthetypeIIasitrequiresapositive(left-handed)phivalue
;TypeIIturn.
NotethehydrogenbondbetweenCOofresidueiandNHofresiduei+3.Thebackbonedihedralanglesofresidueare(-60,120)and(80,0)ofresiduesi+1andi+2,respectivelyofthetypeIIturn.Prolineisoftenfoundinpositioni+1intypeIturnsasitsphiangleisrestrictedto-60anditsimidenitrogendoesnotrequireahydrogenbond.GlycineisfavoredinthispositioninthetypeIIasitrequiresapositive(left-handed)phivalue.;连接相邻两条反平行β-链的环区域叫做“发夹”环;TypeIIIturn.
thehydrogenbondbetweenCOofresidueiandNHofresiduei+3.Thisisasingleturnofright-handed(III)andleft-handed(III)3.10helix,respectively.
Thebackbonedihedralanglesofresidueare(-60,-30)and(-60,-30)ofresiduesi+1andi+2,respectivelyoftheclassicaltypeIIIturn.
;四、蛋白质分子表面的环区域
loop区
;
;loop区
;二级结构的可变性;朊病毒PrionPrP;测定蛋白质二级结构的主要方法;圆二色谱(CD谱);红外光谱;
;StudyofSWI1-ARIDwithFTIRspectra;NMRspectroscope;五、蛋白质结构的拓扑学表达与接触图
;.Distanceplot(contactmap)ofbovinepancreatictrypsininhibitor
;§1-4超二级结构(Motif);DNA结合花样，和钙结合花样;EFhand;EFhand的特
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