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菌株鉴定流程总结--第1页
学习总结
各位领导好,从5月25号开始,在周老师的实验室已经进行了十多天的培训,让我学
到很多。现将我在实验室学习的情况总结汇报。
一、细菌鉴定流程:
1.表观观察鉴定:
培养24h的菌落观察,如:菌落形态(圆形、椭圆形等)、大小(直径多少)、表面
光滑度(光滑和粗糙)和隆起情况(扁平,隆起,凸起等)、边缘整齐、菌落的透明度、菌
落(菌落颜色及是否产生色素等)及培养基的颜色(培养基是否变色)等菌落的描述。
显微观察,观察单个菌的形态(杆状,圆形,椭圆形,螺旋形等),是否有芽孢,
荚膜的情况。
染色观察,革兰氏染色、芽孢染色、荚膜染色。
2.分子鉴定:
细菌DNA的提取(试剂盒法)
⑴将菌种接在适宜的液体培养基中,进行液体发酵,180rpm/min,24h培养。
⑵将摇瓶发酵的菌液加到1.5ml离心管中,10000rpm离心1min,倒掉上清液。
⑶向菌体沉淀中加入200ul缓冲液GA,震荡,至菌体悬浮。如果是革兰氏阳性
菌,则向菌体中加入120ul的Tris盐酸缓冲液,再加入80ul溶菌酶,37℃,30min以上。
⑷向离心管中加入20ul蛋白酶K溶液,混匀。
⑸加入220ul缓冲液GB,震荡15s,70℃放置10min,溶液应变清亮,简短离心
以去除管盖内壁的水珠。
⑹加入220ul无水乙醇,充分震荡混匀15s,可能会出现絮状沉淀,简短离心以
去除管盖内壁的水珠。
⑺将上一步所得溶液和絮状沉淀都加入一个离心柱CB3中(吸附柱放入收集管
中),12000rpm离心30s,倒掉废液,将吸附柱CB3放入收集管中。
⑻向吸附柱CB3中加入500ul缓冲液GD,12000rpm离心30s,倒掉废液,将吸
附柱CB3放入收集管中。
⑼向吸附柱CB3中加入600ul漂洗液PW,12000rpm离心30s,倒掉废液,将吸
附柱CB3放入收集管中。
⑽重复操作步骤⑼。
菌株鉴定流程总结--第1页
菌株鉴定流程总结--第2页
⑾将吸附柱CB3放入收集管中,12000rpm离心2min,倒掉废液,将吸附柱CB3
置于室温放置数分钟,以彻底晾干吸附材料中残余的漂洗液。
⑿将吸附柱CB3转入一个干净的离心管中,向吸附膜中间部位悬空滴加50-200ul
洗脱缓冲液TE(或ddhHO),室温放置2-5min,12000rpm离心2min,将溶液收集到离
2
心管中,-20℃保存。
PCR扩增和电泳检测
细菌扩增引物(16SRrDNA)为:
27F:5-AGAGTTTGATCCTGGTCAGAACGAACGCT-3;
1492R:5-TACGGCTACCTTGTTACGACTTCACCCC-3。
扩增体系:
10xbuffer5μl
dNTP4μl
Mg2+
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