同源建模和分子对接软件应用实例介绍CADD-15.ppt

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计算机辅助药物设计

概论;受体与拮抗剂相互作用模式研究;同源建模;腺苷受体与牛视网膜紫质联配;A1受体跨膜段的三维结构;柔性对接;A1受体与配体相互作用模式;A1受体的重要活性位点;a从胞外俯视的A1腺苷受体结构,抗剂拮BG9719在受体的活性口袋中。

b从通道侧面观察的A1腺苷受体结构。;A1受体的柔性对接--2

疏水缝隙;A1受体的柔性对接--3

亲水作用;A2A受体与配体相互作用模式;A2A受体的重要活性位点;A2A受体的柔性对接--1

活性位点;A2A受体的柔性对接--2

化合物21与受体结合模式;A2A受体的柔性对接--3

化合物93与受体结合模式;总结;分子对接方法的应用;CoMFA应用实例;以活性最高的化合物作为模板

进行低能构象搜索,并用AM1方法优化后进行叠合,叠合点为图中标有*的原子。;5-芳基乙内酰脲类分子拆分的实验值和预测值;立体场等值线图;课后作业

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