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实验一质粒DNA的提取
[实验目的]
通过本实验掌握碱裂解法提取质粒。
[实验原理]
碱裂解法提取质粒是根据共价闭合环状质粒DNA与线性染色体DNA在拓扑学上的差
异来分离它们。在pH值介于12.0~12.5这个狭窄的范围内,线性的DNA双螺旋结构解开
而被变性,尽管在这样的条件下,共价闭合环状质粒DNA的氢键会被断裂,但两条互补
链彼此相互盘绕,仍会紧密地结合在一起。当加入pH4.8的乙酸钾高盐缓冲液恢复pH至
中性时,共价闭合环状的质粒DNA的两条互补链仍保持在一起,因此复性迅速而准确,
而线性的染色体DNA的两条互补链彼此已完全分开,复性就不会那么迅速而准确,它们
缠绕形成网状结构,通过离心,染色体DNA与不稳定的大分子RNA,蛋白质-SDS复合
物等一起沉淀下来而被除去。
[仪器、材料与试剂]
(一)仪器
1、恒温培养箱
2、恒温摇床
3、台式离心机
4、高压灭菌锅
(二)材料
1.葡萄糖
2.三羟甲基氨基甲烷(Tris)
3.乙二胺四乙酸(EDTA)
4.氢氧化钠
5.十二烷基硫酸钠(SDS)
6.乙酸钾
7.冰乙酸
8.乙醇
9.盐酸(HCl)
10.Bt菌株
11.吸头、小指管
(三)试剂
1、溶液I
50mmol/L葡萄糖
5mmol/L三羟甲基氨基甲烷(Tris)Tris·HCl
10mmol/L乙二胺四乙酸(EDTA)(pH8.0)
2、溶液II
0.4mol/LNaOH,2%SDS,用前等体积混合
3、溶液III
5mol/L乙酸钾60mL
冰乙酸11.5mL
水28.5mL
4、TE缓冲液
10mmol/LTris·HCl
1mmol/LEDTA(pH8.0)
5、70%乙醇(放-20℃冰箱中,用后即放回)
[实验步骤]
(一)提取质粒
1、将Bt菌株接种于LB液体培养基中,30℃振荡培养过夜。
2、取1ml培养物倒入Eppendorf管中,12000r/min离心30sec。
3、吸去培养液,使细胞沉淀尽可能干燥。
4、将细菌沉淀悬浮于100μL冰预冷的溶液I中,剧烈振荡。
5、加200μL溶液II(新鲜配制),盖紧管皿,快速颠倒5次,混匀内容物,将Eppendorf
管放在冰上。
6、加入150μL溶液III(冰上预冷),盖紧管口,颠倒数次使混匀,冰上放置5min。
7、12000r/min,离心5min,将上清夜转至另一Eppendorf管中。
8、向上清夜加入2倍体积乙醇,混匀后,室温放置5~10min。12000r/min离心5min。
倒去上清夜,把Eppendorf管倒扣在吸水纸上,吸干液体。
9、用1ml70%乙醇洗涤质粒DNA沉淀,振荡并离心,倒去上清夜,真空抽干或空气
中干燥。
10、50μLTE缓冲液,使DNA完全溶解,-20℃保存。
[实验安排]
本实验一天内可做完。实验结果可结合下一个实验一起观察。
实验二琼脂糖凝胶电泳检测DNA
[实验目的]
通过本实验学习琼脂糖凝胶电泳检测DNA的方法。
[实验原理]
DNA分子在琼脂糖凝胶中泳动时有电荷效应和分子筛效应。DNA分子的高于等电点
的pH溶液中带负电荷,在电场中向正极移动。由于糖-磷酸骨架在结构上的重复性质,相
同数量的双链DNA几乎具有等量的静电荷,因此它们能以同样的速度向正极方向移动。
在一定的电场强度下,DNA分子的迁移速度取决于分子筛效应,即DNA分子本身的大小
和构型。具有不同的相对分子质量的DNA片段泳动速度不一样,可进行分离
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