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岭南现代临床外科2023年4月第23卷第2期LingnanModernClinicsinSurgery,April.2023,Vol.23No.2111
HMGN基因家族在肝癌中的表达及预后
价值的分析
蔡典葵,李昂,杨思加,韦金星,闵军*
[摘要]目的本研究旨在通过生物信息学方法分析肝癌中HMGN基因家族的表达水平
及其与临床预后的关系。方法应用TCGA和GEO数据库,分析HMGN家族各成员在肝癌
组织与正常组织的表达水平,并进一步分析HMGN家族在肝癌不同分期的表达水平。然
后,HMGN基因家族的表达水平与肝癌患者的预后相关性通过GEPIA数据库进行分析。
最后,利用LASSO分析,构建肝癌预后风险模型,并评价模型的预测效果。结果在肝癌
组织中,HMGN1、HMGN2和HMGN4的表达水平显著高于正常组织。肝癌Ⅰ期的HMGN1、
HMGN2、HMGN3和HMGN4的表达水平显著低于Ⅱ期和Ⅲ期。HMGN1、HMGN2和HMGN4
的表达水平与肝癌患者的总体生存率呈负相关。HMGN1、HMGN2、HMGN3和HMGN4的表
达水平与肝癌患者的无病生存率呈负相关。基于HMGN2、HMGN3和HMGN4的预后风险
模型可评估肝细胞癌患者的预后。结论HMGN1、HMGN2和HMGN4可能成为肝癌新的诊
断和治疗靶点。
[关键词]HMGN;肝癌;生物标志物;生物信息学;预后
doi:10.3969/j.issn.1009⁃976X.2023.02.004中图分类号:R735.7文献标识码:A
ExpressionandprognosticvalueofHMGNgenefamilyinhepatocellularcarcinoma
CAIDian⁃kui,LIAng,YANGSi⁃jia,WEIJin⁃xing,MINJun
DepartmentofHepatobiliarySurgery,SunYat⁃SenMemorialHospital,SunYat⁃SenUniversity,Guang⁃
zhou,510120,China.
Correspondingauthor:MINJun,minjun@mail.sysu.edu.cn
[Abstract]ObjectiveThepurposeofthisstudywastoanalyzetheexpressionlevelofHMGNgene
familyinhepatocellularcarcinoma(HCC)anditscorrelationwithclinicalprognosisbybioinformatics
method.MethodsTheTCGAandGEOdatabasewasusedtoanalyzetheexpressionlevelofHMGN
familymembersinHCCtissuesandnormallivertissue,andtofurtheranalyzetheexpressionlevelof
HMGNfamilymembersindifferentstagesofHCC.Then,thecorrelationbetweentheexpressionlevelof
HMGNgenefamilyandprognosisofHCCpatientswasanalyzedbyGEPIAdatabase.Finally,prognostic
riskmodelofHCCwasconstructedbyLASSOanalysis,andthepredictioneffectofthemodelwasevalu⁃
ated.ResultsTheexpressionlevelsofHMGN1,HMGN2andHMGN4inHCCtissuesweresignificant⁃
lyhigherthanthoseinnormaltissues.TheexpressionlevelsofHMGN1,HMGN2,HMGN3andHMGN4
instageⅠofHCCweresignificantlylowerthanthoseinstageⅡandStageⅢ.Theexpressionsof
HMGN1,HMGN2andHMGN4werenegativelycorrelatedwiththeoverallsurvivalofpatientswith
HCC.TheexpressionofHMGN1,HMGN2,HMGN3andHMGN4wasnegative
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