新型冠状病毒全基因组测序通用技术要求 编制说明.pdf

《新型冠状病毒全基因组测序通用技术要求》

征求意见稿编制说明

一、工作简况

本标准由国家药品监督管理局提出，全国医用临床检验实验室和体外诊断系

统标准化技术委员会（SAC/TC136）归口。任务来源为国家标准化管理委员会下

发【2024】16号《国家标准化管理委员会关于下达2024年第一批推荐性国家标

准计划及相关标准外文版计划的通知》，本项目计划号T-464。

本标准的主要起草单位为：中国食品药品检定研究院、中国科学院微生物研

究所、中国海关科学技术研究中心、国家卫健委临床检验中心、北京市医疗器械

检验研究院、深圳市疾病预防控制中心、中国科学院北京基因组研究所、天津金

匙医学科技有限公司、广州微远基因科技有限公司、予果生物科技(北京)有限公

司、深圳华大智造科技股份有限公司、四川大学华西医院、中国医学科学院病原

生物学研究所、上海伯杰医疗科技股份有限公司、江苏宏微特斯医药科技有限公

司。

2024年05月14日在北京召开了标准启动工作会，来自企业、审评、检测

机构、医院等126家单位的200余人参加了讨论，国家标准技术审评中心审评二

部主任于亚笛、国家药监局医疗器械标准管理中心标准三室主任郭世富、SAC/TC

136主任委员陈文祥等专家参加了此讨论。会上成立了起草小组，就标准主要大

纲、工作进度及各起草单位承担工作进行了讨论。起草人员分工如下，全篇审核

由中国食品药品检定研究院、国家卫健委临床检验中心、北京市医疗器械检验研

究院负责，前言至第3章由天津金匙医学科技有限公司、广州微远基因科技有限

公司负责，第4-5章由深圳华大智造科技股份有限公司、予果生物科技(北京)有

限公司、中国医学科学院病原生物学研究所负责，其余及统稿工作由中国科学院

微生物研究所、中国海关科学技术研究中心、深圳市疾病预防控制中心、中国科

学院北京基因组研究所、四川大学华西医院、上海伯杰医疗科技股份有限公司、

江苏宏微特斯医药科技有限公司负责。本次会议明确标准适用于对口咽拭子、鼻

咽拭子、气道抽吸液、痰液、肺泡灌洗液、其他呼吸道分泌物或病毒培养物等样

本中的新型冠状病毒的全基因组测序，包括宏转录组测序法、多重聚合酶链反应

（PCR）测序法及杂交捕获测序法等。本文件适用的测序原理包括可逆末端终止

测序、联合探针锚定聚合测序、纳米孔测序等。会后根据意见，对草案进行进一

步完善。

2024年6月11-12日在北京召开了标准讨论会，来自企业、审评、检测机

构、医院等单位的代表共计260余人参加了讨论，邀请到安徽医科大学附属省立

医院沈佐君主任、清华大学郭永老师、中国食品药品检定研究院黄杰副所长、中

国疾病预防控制中心病毒病预防控制所吴长城主任、上海市东方医院田文杰老师

等专家参加了本次标准讨论会，参会代表具有广泛代表性。与会专家对标准内容，

标准结构和技术内容进行充分讨论。与会专家及代表对工作组讨论稿进行了全面

讨论，形成以下主要意见：

1）“4.3核酸提取及纯化”由原稿的“应对核酸提取及纯化功能，如效率、纯

度、完整性等进行验证。”修改为“应对核酸提取及纯化效率，如产量、纯度及

完整性等进行验证”。

2）“4.4.1核酸定量”原稿中的“数字PCR方法”可有两种修改方式：①保留，

考虑到ddPCR方法是未来定量的趋势，随着时代的发展，应用会越来越广泛；而

具体数值应等待本次验证的实验结果完成后，进行补充，如：使用数字PCR方法

测定样本中的病毒载量，在浓度≥XXcopies/mL时，开展全基因组测序；浓度＜

XXcopies/mL时，不一定满足高通量测序的核酸浓度要求，但可优化实验条件后

进行测序。②删除“数字PCR方法”的描述，因现阶段使用qPCR方法足够完成

核酸的初步定量工作，无须使用数字PCR进行定量。

3）“4.4.2片段分析（可选）”由原稿的“应对病毒核酸片段分析方法进行验

证”修改为“宜对病毒核酸片段分析方法进行验证”。

4）“4.5测序文库制备”增加如下内容：①宏转录组测序法增加“去除宿主/其

他病原体RNA（可选）”。②多重PCR测序法增加“应根据新冠变异位点的变

化，及时对靶向扩增引物池进行更新”。③应增加纳米孔测序方法。

5）“4.9.1病毒参考基因组”由原稿中的“SARS-CoV-2MN908947.3”修改为

“NC_045512.2”。

6）“4.10.4变异情况分析”删除“包括不限于变异的频率、分布，及对病毒特

性、免疫逃逸能