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基于基因组测序鉴定WNK2作为肝细胞癌的驱动因子和早期
复发的危险因素
一、文章重点汇总(Highlights):
1、对182例中国肝细胞癌进行了测序。
2、WNK2,RUNX1T1,CTNNB1,TSC1和TP53体细胞突变
与根治性手术切除后早期肿瘤复发相关。
3、WNK2在HCC中显示体细胞突变,拷贝数丢失和表达下调。
4、WNK2缺乏导致ERK1/2信号传导激活,TAM浸润和肿瘤
生长及转移。
Abstract
背景与目的
手术切除术后肝细胞癌(HCC)早期复发很常见。然而,尤其是
中国患者中遗传机制与HCC早期复发之间的关联仍然未知。
方法
我们对182个原发性HCC样本进行了全基因组测序(49例),
全外显子组测序(18例)和深度靶向测序(115例)。关注到WNK2,
我们使用Sanger测序和qPCR评估所有编码外显子和另外554个
HCC样品中该基因的拷贝数。我们还探究了WNK2对肿瘤生长和转
移的功能作用和机制。
结果
我们鉴定了5个基因(WNK2,RUNX1T1,CTNNB1,TSC1
和TP53),这些基因都具有体细胞突变,与182例原发性HCC样本
中的手术切除术后早期肿瘤复发相关。针对WNK2,总体细胞突变和
拷贝数丢失分别发生在总共736个HCC样品的5.3%(39/736)和
27.2%(200/736)。两种类型的变异都与WNK2蛋白低表达水平、
较高的早期肿瘤复发率和较短的总体存活率等有关。生物功能研究揭
示了WNK2的肿瘤抑制作用:其失活导致HCC细胞中ERK1/2信
号传导活化、肿瘤相关巨噬细胞浸润和肿瘤生长与转移。
结论
我们的结果描绘了描述中国HCC的基因组事件,并确定WNK2
是根治性切除(curativeresection)术后早期HCC复发的驱动因素。
关键词
肝细胞癌;早期复发;测序;WNK2
Introduction
肝细胞癌(HCC)是一种相对常见的癌症,发病率和死亡率都在
上升。每年全球发生的782,500例新发肝癌病例和745,500例因肝癌
死亡的病例中,大约有一半发生在中国。在中国大多数HCC来自乙型
肝炎,其他风险因素如黄曲霉毒素和马兜铃酸也可能在HCC发展中起
重要作用。与其他国家和地区的患者相比,这些病因可能导致中国患
者的遗传改变和治疗目标不同。
在过去的十年中,新的发现揭示了HCC发病机制的分子基础。随
着技术的进步,一些开创性的研究已经描绘了肝癌发生的遗传全景
(thegeneticlandscape),包括染色体6p21(VEGFA)和
11q13(FGF19/CNND1)的扩增、9号染色体上的缺失
(CDKN2A)。TP53和CTNNB1编码区的突变以及其他一些基因
(如AXIN1,ARID2,ARID1A,TSC1/TSC2)的低频突变等影响
了25-30%的HCC患者,定义了在HCC中常见的反常基因的核心途
径。许多与HCC相关的基因组变化已在西方和日本人群中得到描述;
然而,无论是与特定的黄曲霉毒素相关的HCC还是与低测序深度相关
的HCC,中国人群中HCC的基因组全景仅在小患者队列中进行了研
究。为了全
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