蛋白质质谱样品污染及预防专家讲座.pptx

生物质谱室生命科学研究中心1062白质质谱样品污染及预防专家讲座第1页

蛋白质组样品污染污染起源角蛋白：皮肤，毛发，衣服，灰尘PEG：塑料试剂瓶，离心管，保鲜膜和PE塑料手套（PEG是塑料加工中“润滑油”，国产离心管PEG残留可能较多）表面活性剂：蛋白提取液，清洗玻璃试剂瓶残留 （SDS，CHAPS，Triton，Tweens，ND-40）影响范围角蛋白：角蛋白质谱信号压制样品蛋白质谱信号，引发低丰度蛋白信号丢失。造成色谱柱污染和超载。PEG和表面活性剂：抑制多肽电离，降低样品信号强度，驻留色谱柱，降低分离效率。蛋白质质谱样品污染及预防专家讲座第2页

角蛋白和PEG：污染SDS胶和蛋白溶液表面活性剂：污染蛋白溶液蛋白质组样品污染影响角蛋白污染无法根除，可经过以下方法缓解交叉污染：专用，分开储存优质离心管环境污染：洁净试验室空间，降低灰尘和空气流动接触污染：洁净乳胶手套和试验服表面活性剂和PEG：使用超滤管（10kDa）去除样品污染处理方法蛋白质质谱样品污染及预防专家讲座第3页

样品污染问题污染较少SDS样品酶解后TIC图严重PEG污染SDS样品酶解后TIC图PEG污染信号4蛋白质质谱样品污染及预防专家讲座第4页

相对污染较少SDS样品酶解后质谱图严重PEG污染SDS样品酶解后质谱图PEG污染信号蛋白质质谱样品污染及预防专家讲座第5页

污染较少SDS样品蛋白判定结果：目标蛋白得分远高于角蛋白污染蛋白判定结果角蛋白污染结果蛋白质质谱样品污染及预防专家讲座第6页

严重角蛋白污染SDS样品蛋白判定结果：角蛋白得分远高于目标蛋白蛋白判定结果角蛋白污染结果蛋白质质谱样品污染及预防专家讲座第7页