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用于鉴定人类腺病毒55型的引物组合物以及它们的应用的
制作方法
用于鉴定人类腺病毒55型的引物组合物以及它们的应用的
制作方法
本发明公开了一种用于鉴定人类腺病毒55型的引物组合物
以及它们的应用。本发明提供的引物组合物,包括DNA片段
-Ⅰ、DNA片段-Ⅱ、DNA片段-Ⅲ和DNA片段-Ⅳ,均为单链DNA
片段,依次如序列1、序列2、序列3、序列4所示。所述引
物组合物还可包括单链DNA片段-Ⅴ和/或单链DNA片段-Ⅵ,
依次如序列5、序列6所示。本发明适用于对人类腺病毒55
型进行特异性检测和定量分析。本发明的优点:(1)只需
在恒定温度就能扩增反应,不需要特殊设备;(2)特异性
高;(3)快速高效,扩增反应在短时间内即可完成;(4)
灵敏度高;(5)鉴定方便简单。本发明特别适用于临床样
本中病毒的快速检测。
【专利说明】用于鉴定人类腺病毒55型的引物组合物以及
它们的应用
【技术领域】
[0001]本发明涉及一种用于鉴定人类腺病毒55型的引物
组合物以及它们的应用。
【背景技术】
[0002]人腺病毒(HumanAdenovirus,HAdV)是一群无包
膜的双链DNA病毒,分为1?55个血清型,分别划入A?F共6
个血清学分组。人腺病毒经呼吸道和消化道传播,引起多
种感染,对小儿和免疫缺陷者危害严重。腺病毒感染人体可
能引发的疾病包括:急性腺病毒肺炎、急性胃肠炎、眼角膜
炎、乳糜泻和急性间质性肾炎等。在儿童急性下呼吸道感染
患者中腺病毒感染阳性率可高达4.1%。在最近几十年的北
美、欧洲及亚洲均认为人类腺病毒B组感染是导致急性呼
吸系统感染(ARD)的重要因素。
[0003]HAdVlUHAdVH型属于腺病毒B组,传统的HAdVll
型主要导致肾及泌尿系统的感染,HAdVH则引起人呼吸系统
感染。新发现的人类腺病毒55型(HAdV55),在其现之初命
名为HAdVlla,对人有较强的致病性,易在军队、学校等密
集人群发生呼吸道传染病流行,在免疫低下的人群中甚至
出现了死亡病例。基因分析表明HAdV55是HAdVH与HAdVll
的Hexon区域重组并发生若干核苷酸突变得到的毒株。
[0004]腺病毒的现有检测方法主要为普通PCR和实时荧
光定量PCR等。普通RT-PCR和实时荧光定量RT-PCR等常需
要花费较长时间或者需要特定的仪器,难以满足暴发疫情快
速诊断的需要。
[0005]环介导等温扩增法(loop-mediatedisothermal
amplification,LAMP)法具有在等温条件下即可高速、高特
异、高灵敏的扩增靶序列的特点。该方法利用4条特异引物
(F3、FIP、B3和BIP)在高活性链置换DNA聚合酶作用下,
不断复制扩增核酸。在反应体系中可添加2条环状引物LF
和LB,它们也分别与茎环结构结合启动链置换合成,周而复
始。扩增的最后产物是具有不同个数茎环结构、不同长度
DNA的混合物。
【发明内容】
[0006]本发明的目的是提供一种用于鉴定人类腺病毒55
型的引物组合物以及它们的应用。
[0007]本发明提供的第一组引物组合物(引物组合物甲),
包括DNA片段-I、DNA片段_II、DNA片段-III和DNA片段
-IV;所述DNA片段-I、所述DNA片段-II、所述DNA片段-III
和所述DNA片段-IV均为单链DNA片段;所述DNA片段-I如
序列表的序列1所示,所述DNA片段-II如序列表的序列2
所示,所述DNA片段-III如序列表的序列3所示,所述
DNA片段-IV如序列表的序列4所示。所述引物组合物甲具
体可由所述DNA片段-I、所述DNA片段-II、所述DNA片段-III
和所述DNA片段-IV组成。所述引物组合物甲还可包括DNA
片段-V和/或DNA片段-VI;所述DNA片段-V和所述DNA片段
-VI均为单链DNA片段;所述DNA片段-V如序列表的序列5
所示,所述DNA片段-VI如序列表的序列6所示。所述引
物组合物甲具体可由所述DNA片段-I、所述DNA片段-II、
所述DNA片段-III
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