聚类分析在中药研究中的运用专家讲座.pptxVIP

聚类分析概述相同性度度量聚类分析方法中药分析聚类分析应用聚类分析意义聚类分析在中药研究中的运用专家讲座第1页

概述聚类分析在中药研究中的运用专家讲座第2页

聚类分析概述聚类分析指将物理或抽象对象集合分组成为由类似对象组成多个类分析过程。聚类目标依据已知数据，计算各观察个体或变量之间亲疏关系统计量（距离或者相关系数）。依据某种准则（最短距离法、最长距离法、中间距离法、重心法），使得同一类内差异较小，而类与类之间差异较大，最终将观察个体或变量分为若干类。聚类分析在中药研究中的运用专家讲座第3页

聚类分析概述聚类分析特点聚类分析能够将一组数据按照本身内在规律较合理地分为几类，大大缩小了以往全凭主观判断所造成误差，使数据分析结果更具客观性。更主要是，聚类分析应用能够完成以往人工所不能完成工作。聚类分析在中药研究中的运用专家讲座第4页

聚类分析概述聚类分析用于中药研究中药复方中包含多味中药，经过不一样组合实现对疾病治疗；每一个中药中包含了大量化合物成份，不一样功效中药中含有不一样化合物成份，也可能含有相同成份，这些化合物成份之间相互作用（协同或抑制）经过多靶点、多路径而实现了药效；所以，不论是复方还是单味中药其组成都很复杂，分析困难；方剂君中药h多种化合物中药j多种化合物臣中药e多种化合物佐中药c多种化合物中药d多种化合物使中药a多种化合物中药b多种化合物聚类分析在中药研究中的运用专家讲座第5页

聚类分析概述聚类分析用于中药研究中药组成复杂这一特点使得对中药作用机理研究比较困难，假如能够对这些复杂成份进行分类，在分类基础上去分析每个类内成份特征，和类别之间关联，将有利于作用机理研究。复杂的研究对象类1类2类3类4聚类分析在中药研究中的运用专家讲座第6页

聚类分析相同度度量聚类分析在中药研究中的运用专家讲座第7页

聚类分析相同度度量相同度度量方法距离测度关联性测度相关性测度聚类分析在中药研究中的运用专家讲座第8页

距离测度假设每个对象有n个相关变量，每个变量对应于一个数值，则每个对象能够看成是n维空间一个点，m个对象就是n维空间m个点，经过计算两个点之间聚类表示相关度；距离定义方法：欧式（Euclidian）距离明氏（Minkowski）距离马氏（Mahalanobls）距离聚类分析在中药研究中的运用专家讲座第9页

距离测度例子：不一样种类但药用类似中药中往往含有相同化合物或金属元素，但它们含量不一样，依据组成成份含量分析中药相关度能够采取距离测度,进而利用聚类研究药品金属元素与药品疗效相关性.以下表（成份指成份含量占整个中药百分比）中药成份1成份2……成份n10.450.04……0.3120.330.098……0.1230.030.03……0.24……m0.0220.04……0.6聚类分析在中药研究中的运用专家讲座第10页

关联性测度当个案不能由有意义n维数值来表示时，常依据一些特征存在是否来比较个案之间相同性。相同个案比不相同有更多共同特征。关联性度量时，研究对象有n个特征，能够用0/1表示该对象是否符合某个特征，对两个研究对象各个特征进行匹配计算其相同度。关联性测度方法：简单匹配系数：s=(a+d)/n;(a:1-1匹配个数，d:0-0匹配个数，n:特征个数)雅可比系数：s=a/n;聚类分析在中药研究中的运用专家讲座第11页

关联性度量例子1：方剂相同性每个方剂对应不一样中药组成，分别用0/1表示某种方剂是否含有某味中药，经过关联度量来计算方剂之间在组成相同性；方剂中药1中药2……中药m-1中药m101……10210……00301……10……10……10n00……01聚类分析在中药研究中的运用专家讲座第12页

关联性度量例子1：方剂相同性每个方剂对应不一样功效，分别用0/1表示某种方剂是否含有某种功效，经过关联度量来计算方剂之间功效相同性；方剂功效1功效2……功效k-1功效k111……01210……00310……10……01……11n00……11聚类分析在中药研究中的运用专家讲座第13页

关联性度量例子2：中药相同性每一味中药对应各种功效，经过关联度计算中药在功效方面相同性；单味药功效1功效2……功效k-1功效k药111……01药210……00药310……10……01……11药n00……11聚类分析在中药研究中的运用专家讲座第14页

关联性度量例子2：中药相同性每一味中药都包含很多成份，经过关联度计算中药成份组成方面相同性；单味药成份1成份2……成份m-1成份m药111……01药210……00药310……10……01……11药n00……11聚类分析在中药研究中的运用专家讲座第15页

相关度研究多个对象之间相同性惯用距离，研究指标（变量）之间相同性惯用有：夹角余弦和相关系数。相关度方法夹角余弦Pearson相关系数聚类