LC-MS- Xcalibur定性浏览器发DVD是.pdf

第六章Xcalibur定性浏览器

1双击图标，进入Xcalibur工作站

2点击（QualBrowser图标）进入定性浏览器

3快捷图标解释如下：

4提取不同质荷比离子的提取离子流

点击图标打开数据文件，调出色谱图，点击右上角图钉激活窗口（激活窗口后图

钉为绿色），鼠标右键选择Ranges，见下图：

出现如下ChromatogramRanges对话框后，在Scanfilter选项，下拉选择要提取的离子通

道；将Plottype改为MassRange，在Range(s)中输入要提取的离子的质荷比；

点击“OK”，即可提取该质荷比的离子（默认的偏差容忍度为500mmu）的提取离子流，如

下图。

如果是高分辨质谱，如QExactive，LTQObitrap，Fusion等系列仪器做提取离子流时

可将质荷比的偏差容忍度调至ppm，操作如下：

在数据图谱中任何位置点击鼠标右键选择Ranges，在对话框中选择Automaticprocessing，

在Masstolerance中设置质量精度（一般设置为5ppm）；Massprecision中设置显示小数点后

位数（一般设置为5），如下图所示：

对谱图做平滑处理：调出想要的色谱图，鼠标右键选择Ranges，在ChromatogramRanges

对话框中选择Automaticprocessing，在Smoothing中的Enable打钩，Type中选择Boxcar

或Gaussian（两种不同的平滑方式），Points中输入平滑点数（1~15之内的奇数），即可对色

谱图进行平滑处理。

5在一个cell中显示多个RawFile的色谱图。

点击色谱图右上角图钉激活，鼠标右键选择Ranges出现如下对话框，点击红色圈内的

图标，选择另外一个样品图谱进行比较；如需比较多个，勾选图中“”标识，继续添加需比

较样品即可；

但是每个cell最多只能显示8个通道，如需同时查看更多的数据谱图，可点击下图中标

识，横向或竖向添加cell，然后再按照上述方法添加数据文件即可。

6扣除背景

（1）选取原图上某段时间的扫描作为背景进行扣除

打开数据文件，调出质谱图，激活质谱图右上角图钉，鼠标右键选择SubtractSpectra，

选择一段（1Range）或者两段（2Ranges）时间扫描的谱图进行扣除；

在对应的总离子流谱图背景区域内拖动鼠标左键选取时间范围背景，释放鼠标按键即可

得到扣除所选时间范围背景质谱图；

（2）选取一个基质空白作为背景进行背景扣除

点击菜单栏Tools下BackgroundSubtract，

弹出如下窗口：在Input/File中添加待扣除背景的样品数据，在Background/File中添加

作为背景的空白基质数据，Output/Name中为扣除基质空白之后样品的名称（不可修改），

Folder是扣除背景后数据的保存路径（可修改），Scope中可以选择扣除整个空白基质数据

或扣除某一时间点的数据。

7建立和使用Layout文件

（1）建立Layout文件

可以利用Layout文件保存当前数据窗口内的窗格、布局以及谱图的显示及其处理方法，

点击菜单栏File/Layout/Saveas，会弹出对话框，选择保存路径并命名即可保存Layout文件。

（2）使用Layout文件

打开一张谱图后，点击菜单栏File/Layout/Apply，会弹出对话框，选择要应用的Layout

文件，点击Open，即可应用Layout文件。

8显示积分峰面积及信噪比信息

打开数据文件，对色谱图进行积分：

（1）自动积分

点击快捷图标，只对cell中呈灰色选中窗口的谱图进行积分。

或者，同时对所激活cell中的所有谱图进行积分。

（2）手动积分

打开色谱图，点击激活按钮，选重待积分谱图（选中后呈灰色），点击快捷图标，

点击鼠标左键从色谱峰开始处拖动至积分结尾处即可；

对谱图进行积分之后，点击鼠标右键DisplayOptions/Labels，选择Area