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RNA提取一般步骤总结

rna提取原理:

|用变性剂破坏细胞或组织,然后用氯仿和其他有机溶剂提取RNA,沉淀、洗涤、枯燥,最终溶解。然而,RNA酶无处不在,随时都可能降解RNA,因此在试验中有很多地方需要

留意,假设无视它们,之前的努力就会白费。RNA提取的一般步骤

全部rna的提取过程中都有五个关键点,即:样品细胞或组织的有效裂开;有效地使核蛋白复合体变性;对内源rna酶的有效抑制;有效地将rna从dna和蛋白混合物中分别;对于多糖含量高的样品还牵涉到多糖杂质的有效除去。但其中最关键的是抑制rna酶活性。rna的提取目前阶段主要可承受两种途径:提取总核酸,再用氯化锂将rna沉淀出来;直接在酸性条件下抽提,酸性下dna与蛋白质进入有机相而rna留在水相。第一种提取方法将导致小分子量rna的丧失,目前该方法的使用频率已很低。试验步骤:

组织裂开→RNA分别→RNA沉淀→RNA洗涤→RNA溶化→RNA保存。

1、裂开组织和灭活rna酶可以同步进展,可以用盐酸胍、硫氰酸胍、np-40、sds、蛋白酶k等裂开组织,参加β-me可以抑制rna酶活性。

2.RNA一般用苯酚、氯仿等有机溶剂和少量异戊醇分别。经过这个步骤和离心,RNA通常分布在上层,并从蛋白质层分别。

3、沉淀rna一般用乙醇、3mnaac〔ph-5.2〕或异丙醇。

4.用70%乙醇清洗RNA。有时,这一步可以省略,以避开RNA被洗掉。洗涤后,可在空气中枯燥或用乙醇枯燥,但不能太干,否则不易溶解。5.Te通常用于溶解RNA。

6、保存rna应当尽量低温。为了防止痕量rnase的污染,从富含rnase的样品〔如胰脏、肝脏〕中分别到的rna需要贮存在甲醛中以保存高质量的rna,对于长期贮存更是如此。从大鼠肝脏中提取的rna,在水中贮存一个星期就根本降解了,而从大鼠脾脏中提取的rna,在水中保存3年仍保持稳定。另外,长度大于4kb的转录本对于痕量rnase的降解比小转录本更敏感。为了增加贮存rna样品的稳定性,可以将rna溶解在去离子的甲酰胺中,存于-70℃。用于保存rna的甲酰胺肯定不能含有降解rna的杂物。来源于胰脏的rna至少可以在甲酰胺中保存一年。当预备使用rna时,可以使用以下方法沉淀rna:参加naac至0.3m,12,000×g离心5分钟。i氯化锂法提取总rna:

该方法使用高浓度尿素变性蛋白质并抑制核糖核酸酶,使用氯化锂选择性沉淀RNA。特别适用于从大量样本中提取少量组织RNA。它具有快速、简便的优点,但也存在DNA污染小、RNA产量低、小RNA片段丧失等缺点。测试试剂:

1、氯化锂/尿素溶液【氯化锂126g(3m)尿素、360g(6m)加水至1l,过滤灭菌】2、悬浮液【10mm?tris-hcl(ph7.6),1mm?edta(ph8,0),0.5%sds】试验步骤:

1.对于大量组织或细胞,每克组织或细胞参加5-10ml氯化锂尿素溶液,匀浆器高速匀浆2分钟;对于少量细胞〔107个细胞/ml〕,向每克组织或细胞中添加0.5ml氯化锂尿素溶液,手动混合,并将其转移到Ependof管中。

2、匀桨液在0-4℃放置4小时后,12023g离心30分钟。

3.取沉淀,参加原均化液的1/2体积氯化锂尿素溶液,重复步骤2。

4、沉淀用原匀桨液1/2体积的氯化锂-尿素溶液复溶后,参加等体积酚/氯仿/异戊醇在室温放置15-30分钟并不时摇动混匀,4000g离心5分钟。

5.取上层水相,参加1/10倍体积的3M醋酸钠〔ph5.2〕和2倍体积的乙醇,在-20℃下放置1小时,离心5000g。

6、70%乙醇洗沉淀一次。真空枯燥。

7.通过将沉淀溶解在RNA溶解溶液中获得RNA。RNA被重包装并储存在-70℃下。蛋白酶-热酚法

本方法适合于病毒rna的提取试验试剂:

1.蛋白酶K〔最终浓度50ug/ml〕,j5pl6v/T7[/I

2、2×缓冲液:1%sds?20mmtris-hcl(ph7.6)?0.2mnacl试验步骤:

1.向纯化的病毒溶液中参加等体积缓冲液和蛋白酶K,37℃40-50分钟。

2、参加等体积65℃预热的酚溶液,轻徭,在65℃保温5分钟后再轻徭。离心,取上清,氯仿抽提一次。

4.取上层水相,参加1/10倍体积的3M醋酸钠〔ph5.2〕和2倍体积的乙醇,在-20℃下放置1小时,离心5000g〔10000g,10min〕。

70%乙醇洗沉淀一次。真空枯燥。

6.将沉淀溶解在RNA溶解溶液中,获得RNA。RNA被重包装并储

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