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天河二号及其应用简介
2国家超级计算广州中心NATIONALSUPERCOMPUTERCENTERINGUANGZHOU重要内容OUTLINE中心简介软件简介应用简介近期建设
一.中心简介
中心概述4广州市重点建设的科技一号工程,总投资超过25亿元人民币
中心建设历程5四方签订战略合作协议,联合申报“十二五”863项目“天河二号”一期系统研制成功,入驻国家超级计算广州中心大楼中心正式对外提供服务,中心获科技部正式授牌。2011年11月2013年6-10月2014年4-6月
中心建设历程6广州市政府与中山大学签订《广州超算中心固定资产委托管理协议》二期系统计划到达100PF峰值计算速度、Linpack效率60%等目的2015年9月天河二号TOP500实现六连冠天河二号HPCG排行榜五连冠2015年11月2016年6月
“天河二号”7国家“863”计划和“核高基”国家科技重大专题项目的志性成果“天河”新一代高性能计算机系统研制课题自主知识产权的突破亿亿次级高效能计算的计算机系统建设目的峰值运算速度每秒十亿亿次(100PF)以上、全系统Linpack效率60%以上、系统能效比每瓦50亿次(5GF/W)以上Top500六连冠(.6~.6)HPCG五连冠(.6~)
系统概况双路12核IntelXeonE5-2692V2内存64GB(部分128GB)3*IntelXeonPhi加速卡(GPDSP,Matrix)定制的内部高速互联TH2Express-2+全局共享存储系统容量15PB8ComputeBladeComputeFrameSystemComputeRack
天河二号技术特点9异构多态体系构造自主定制互连网络层次式加速存储架构高效自治的软件栈高密度高精度构造工艺
自主定制高速互连网络互连通信系统决定系统大规模扩展结点性能越高,通信规定越高系统规模越大,通信性能越重要天河二号高速支撑100PF系统自主网络协议胖树拓扑构造光电混合互连技术自适应互联架构Speedupofstarccm+(GBEvsTH2Express-2+)
11二.软件简介
适配软件12
适配软件13分类软件名称软件功能特点数值天气预报WRF天气预报海洋WAVEWATCHIII海洋,波浪模型海洋FVCOM非结构网格,有限体积法,自由表面海洋ELCIRC海岸,有限体积,非结构网格大气环境CMAQ空气污染地球系统CESM地球系统模拟,有限元宇宙Cubep3mN-body,大尺度
适配软件14软件名称软件功能特点OpenFOAMFVM方法CFD综合类Code-AsterFEM方法结构分析code-saturneFVM方法CFD传热传质palabosLBM方法,CFDFDS火灾模拟ElmerFEM方法多物理场耦合拟采购商业软件:Ansys、LS-dyna、Abaqus、starccm+、hyperworks
软件布局15Quantum\ESPRESSOABINITOctopusLAMMPSDL_POLYNAMDGROMACSLAMMPSGROMACSDL_MESOOpenFOAMElmerMEEPMPB?nmμmmmpsnsμsms量子力学分子动力学介观动力学宏观力学空间尺度时间尺度
LAMMPS16
QuantumEspresso17中等规模:Au表面:112atoms,2*2*1k-mesh大规模:以porphyrins功能化的CNT:1532atoms,5232electrons,Γpoint(Ref)J.Phys.:Condens.Matter21(2009)395502CrayXT3
商业软件18VASPGaussianCHARMMMaterialStudioAmberWien2k
VASP19NSFC顾客:600+;材料科学方向顾客:177;VASP顾客:78NSFC-广东联合基金超级计算科学应用研究专项
VASP性能测试20VASP5.3.3:16corespernodeOpt.ofZnO:288O,288ZnSCFofZnO:288O,288Zn
QM/MM21通过第三方工具将这两种软件耦合在一起TheNobelPrizeinChemistry2013MartinKarplus,MichaelLevitt,AriehWarshelforthedevelopmentofmultiscalemodelsforcomplexchemicalsystemsGAMESS-UK,NWChem,FHI-ai
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