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摘要
摘要
非蛋白源性氨基酸D-对羟基苯甘氨酸(D-HPG)是一个重要的砌块,在制药工
业中用于生产阿莫西林、青霉素和头孢菌素等。目前已经开发了几种有效的合成
方法包括:化学法和酶法。化学法合成外消旋体DL-HPG,然后动力学拆分获得
D-HPG;其中L-HPG被丢弃造成了原料浪费。而酶法中的双酶(Hase和Case)级联
转化存在底物溶解度低和产率低等问题。本研究中,我们构建了一条以DL-HPG
为底物的三酶级联路径生产D-HPG;并通过蛋白质工程改造提高DAPDH酶的催
化活性。最后通过转化条件优化,实现了D-HPG的高效合成。主要研究结果如下:
(1)生产D-HPG级联路径的设计、构建以及验证。首先,我们设计一条以DL-
HPG为底物的三酶级联路径生产D-HPG。接着,筛选到Escherichiacoli来源的芳
香族氨基酸氨基转移酶(EcAroAT)、Prevorellatimonensis来源的二氨基庚二酸脱
氢酶(PtDAPDH)以及Bacillismegaterium来源的葡萄糖脱氢酶(BmGDH),用作路
径酶催化反应。随后,通过体外催化反应检测到产物生成,经阳离子质谱鉴定验
证了路径的可行性。最后,三个酶体外的催化活性比,确定了低活性的PtDAPDH
是级联反应的限速酶。
(2)PtDAPDH的蛋白质结晶和结构机制解析。首先,重组菌株E.coli-pET28a-
PtDAPDH表达纯化后利用商业化晶体筛选试剂盒进行结晶条件的筛选,获得分
辨率分别为2.47Å的空蛋白(PDB:8HP0)和3.07Å的蛋白-辅酶NADPH复合物
晶体(PDB:8HP3);随后进行晶体二级结构分析,并根据分子对接模型进行
关键残基功能的突变验证;最后推测出还原胺化机制。
(3)理性设计提高PtDAPDH的催化活性。基于晶体结构和催化机制分析,提
出“重塑结合口袋和构象”的策略进行蛋白质工程改造。获得的最优突变体
PtDAPDHM4(W121V/H227I/R181T/S70D/S160R)相对于野生型,酶活提高了25.6倍,kcat/Km提
高了26.57倍;蛋白结构比较及MD模拟显示:(i)底物结合口袋的扩大,缩短了底
物与NADPH之间氢化物转移距离;MD模拟表明突变体活性位点周围的氢键网络
比野生型更广泛。(ii)残基S72D与S160R突变后,形成额外的作用力增强了域间相
互作用网络,增加了闭合态构象分布。
(4)三酶级联组装全细胞生产D-HPG。用PtDAPDHM4替换路径中的
PtDAPDH,转化实验表明还原胺化HPGA这一限速步骤被消除。随后进行转化条
件的优化后,将反应放大至3L发酵罐,10h内可以转化40g·L-1DL-HPG生成19.8
g·L-1D-HPG,总滴度为39.8g·L-1,转化率为49.5%,ee99%。
关键词:D-对羟基苯甘氨酸;内消旋-二氨基庚二酸脱氢酶;催化机制;蛋白质
工程;多酶级联
I
Abstract
Abstract
Thenon-proteinogenicaminoacidD-p-hydroxyphenylglycine(D-HPG)isan
importantbuildingblockusedinthepharmaceuticalindustryfortheproductionof
amoxicillin,penicillin,andcephalosporin.Severalefficientsynthesismethodshave
beendeveloped,includingchemicalandenzymaticmethods.Chemicalmethods
typicallysynthesizeracemateDL-H
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