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新型冠状病毒的小分子抗病毒药物的研
究进展
摘要:新冠病毒传染性极强,2019年在全球流行爆发,严重威胁人类生命健
康,给全球造成了巨大的医疗、经济和社会破坏。重症COVIDခ19患者病死率高,
目前无特效治疗药物,现有的药物治疗主要是通过抑制病毒复制、抗炎及免疫调
节等机制起效。对于COVIDခ19患者,早期使用合适、有效的治疗药物会降低住
院率及死亡率,并降低医疗成本,减轻医务人员负担。
关键词:新型冠状病毒;小分子;抗病毒药物;研究进展
引言
在过去三年,由新型冠状病毒(SARS‐CoV‐2)引起的新型冠状病毒感染
(COVID‐19)的大流行带来了一场全球性公共卫生危机,全世界仍在为将
COVID‐19变成一种可以预防和治疗的疾病而不懈努力。疫苗的成功研发及人群
的广泛接种虽可使SARS‐CoV‐2感染者出现症状、重症、危重症以及死亡的人
数显著减少,但疫苗的效力还是受到了病毒进化和新变种出现的影响。此外,免
疫抑制的人群对疫苗接种的抗体反应较差,该人群接种疫苗后极易出现
SARS‐CoV‐2严重感染并发展成危重型COVID‐19。因此,COVID‐19的防治不
能仅靠疫苗,仍需要有效的抗病毒治疗药物以阻止疾病的进展。抗病毒药物可在
SARS‐CoV‐2感染的各个阶段提供帮助,包括暴露前或暴露后的预防、早期治疗
和晚期治疗。
1SARS-CoV-2的病毒复制特征
SARS‐CoV‐2的主要结构蛋白包括刺突蛋白(spikeprotein,S)、膜蛋白
(membraneprotein,M)、包膜蛋白(envelopeprotein,E)和核衣壳蛋白
(nucleocapsidprotein,N)。S蛋白包括两个负责与宿主细胞受体结合的功能
亚基:用于与受体结合的结构域S1亚基和用于与病毒融合到细胞膜的S2亚基。
SARS‐CoV‐2进入宿主细胞首先取决于S1亚基与细胞血管紧张素转换酶2受体
的结合,使病毒附着在靶细胞表面,然后由一种特定的蛋白酶,即跨膜丝氨酸蛋
白酶2对S蛋白进行水解切割,使病毒通过受体介导的胞吞作用进入宿主细胞。
在宿主细胞质中,SARS‐CoV‐2RNA被释放并进行基因组复制和病毒蛋白合成,
在完成病毒粒子的组装和释放后感染邻近细胞或向体外传染。可见,
SARS‐CoV‐2的病毒复制过程,需要以ACE2作为进入受体,且需要TMPRSS2来
激活蛋白S。此外,主蛋白酶,又称3‐胰凝乳蛋白酶样蛋白酶,其与木瓜蛋白
酶样蛋白酶在SARS‐CoV‐2病毒复制过程中都是必不可少的,RNA依赖性RNA聚
合酶也在病毒复制中起着至关重要的作用,这些蛋白酶均可作为小分子抗病毒药
物的治疗靶点。
2抗SARS-CoV-2小分子药物的研发基础
2.1SARS-CoV-2的生命周期及感染机制
SARS-CoV-2是一种单链正义RNA病毒,有包膜,直径16~140nm,属β冠状
病毒属。SARS-CoV-2与SARS-CoV基因组序列相似性为79%,与中东呼吸综合征
冠状病毒相似性为50%。SARS-CoV-2的生命周期主要包括病毒附着、膜融合、基
因组复制、病毒粒子的组装和释放。首先,SARS-CoV-2通过S1亚基受体结合域
(RBD)与宿主血管紧张素转换酶2(ACE2)受体相互作用,触发S2亚基构象变
化,介导病毒附着在宿主的细胞膜上;同时,在膜融合过程中,S蛋白可被宿主
丝氨酸蛋白酶2(TMPRSS2)激活,从而启动病毒包膜与宿主细胞质膜融合。病毒
进入宿主后,SARS-CoV-2RNA被宿主复制翻译,在2个开放阅读框ORF1a和
ORF1b中产生2个多蛋白pp1a和pp1ab,这2种多蛋白可被由病毒编码的3CL蛋
白酶和木瓜蛋白酶(PLpro)水解成非结构蛋白1-16(nsp1-16),形成病毒复合
体,参与病毒的转录与复制。随后SARS-CoV-2的结构蛋白被转译,并负责病毒
粒子的组装,组装好的病毒粒子通过高尔基体运输,最终分泌到细胞表面。
2.2现有抗SARS-CoV-2小分子药物的阻断机制
现阶段,小分子抗SARS-CoV-2药物研发已取得突破性进展,主要以病毒生
命周期中的重要环节为靶点终止病毒复制。依赖RNA的RNA聚合酶(RdRp)即
nsp12,是病毒感染过程中调节病毒RNA复制和转录的重要酶,在辅助因子nsp7
和nsp8作用下催化病毒RNA链的合成。nsp12、nsp
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