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<>内为需要输入的内容，但不包括括号。所有命令都需要在MrBayes>的提示下才能输入。
文件格式：
文件输入，输入格式为Nexusfile（ASCII，asimpletextfile，如图）：
或者还有其他信息：
interleave=yes代表数据矩阵为交叉序列interleavedsequences
nexus文件可由MacClade或者Mesquite生成。但Mrbayes并不支持thefullNexusstandard。
同时，Mrbayes象其它许多系统软件一样允许模糊特点，如：如果一个特点有两个状态
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