细菌分类与鉴定.ppt

第1页，讲稿共35页，2023年5月2日，星期三地球上的物种估计大约有150万，其中微生物超过10万种，而且其数目还在不断增加。第2页，讲稿共35页，2023年5月2日，星期三生物分类的二种基本原则：a）根据表型(phenetic)特征的相似程度分群归类，这种表型分类重在应用，不涉及生物进化或不以反映生物亲缘关系为目标。b）按照生物系统发育相关性水平来分群归类，其目标是探寻各种生物之间的进化关系，建立反映生物系统发育的分类系统。从进化论诞生以来，已经成生物学家普遍接受的分类原则生物系统学(systematics)第3页，讲稿共35页，2023年5月2日，星期三一、分类单元及其等级界（Kingdom）(Regnum)门（Phylum）(Phylum)纲（Class）(Classis)目（Order）(Ordo)科（Family）(Familia)属（Genus）(Genus)种（Species）(Species)第4页，讲稿共35页，2023年5月2日，星期三常用的细菌分类学术语：1）培养物(culture)：一定时间一定空间内微生物的细胞群或生长物。如微生物的斜面培养物、摇瓶培养物等。2）菌株(strain)：从自然界中分离得到的任何一种微生物的纯培养物都可以称为微生物的一个菌株；对不同来源的同一种细菌称为该菌的不同菌株。同一种细菌可有许多菌株，其主要性状应该完全相同，次要性状可稍有差异，通常用地名或动物名的缩写加编号作菌株名。第5页，讲稿共35页，2023年5月2日，星期三3）型(form或type)：常指亚种以下的细分。当同种或同亚种不同菌株之间的性状差异，不足以分为新的亚种时，可以细分为不同的型。（如不同血清型、噬菌型等）微生物的种：具有高度特征相似性的菌株群，这个菌株群与其他类群的菌株有很明显的区别。菌株与型的区别：菌株之间不存在鉴别性特征的差异，命名不同的菌株无需分类学依据，不同型的细菌之间存在鉴别性特征的差异，命名或鉴定不同的型必需有分类学依据。4）种（species）：物种，生物分类中基本的分类单元第6页，讲稿共35页，2023年5月2日，星期三二、细菌的命名细菌的命名依据“国际细菌命名法规”的规定，学名用拉丁文，遵循“双名法”。所谓“双名法”就是每一种细菌的拉丁文名称由属名和种名两部分构成，属名第一个字母必须大写，其余均应小写（即使种名以人名或地名命名）。整个属名及种名在出版物中应排成斜体。如：Escherichiacoli属名+种名Salmonellapullorum(S.pullorum)第7页，讲稿共35页，2023年5月2日，星期三属名重复出现，可缩写如：E.coli（大肠杆菌）；S.pullorum（鸡白痢沙门氏菌）只确定属名，未确定种名的某一株细菌Salmonellasp.只确定属名，未确定种名的若干菌株Salmonellaspp.亚种用subsp.（正体）表示Pasteurellamultocidasubsp.septica几种不同的书写情况：第8页，讲稿共35页，2023年5月2日，星期三由于细菌分类单元的划分缺乏一个易于操作的统一标准，为了减少因采用不同标准界定分类单元所造成的混乱，细菌系统分类也像其他生物分类一样采用“模式概念”种和亚种指定模式菌株（typestrain）；亚属和属指定模式种（typespecies）；属以上至目级分类单元指定模式属（typegenus）；模式菌株应送交菌种保藏机构保藏，以便备查考和索取。美国典型培养物保藏中心（ATCC）德国微生物及细胞保藏中心（DSM）第9页，讲稿共35页，2023年5月2日，星期三细菌分类命名权威杂志:国际系统与进化微生物学杂志（InternationalJournalofSystematicandEvolutionaryMicrobiology,IJSEM）任何分离鉴定的新细菌的有关论文应在该杂志发表第10页，讲稿共35页，2023年5月2日，星期三二、原核微生物分类系统（一）《伯杰氏鉴定细菌学手册》(Bergey’sManualofDeterminativeBacteriology)美国宾夕法尼亚大学的细菌学教授伯杰(D.Bergey)(1860-1937)伯杰氏手册:是目前进行细菌分类、鉴定的最重要参考书，其特点是描述非常详细，包括对细菌各个属种的特征及进行鉴定所需做的实验