基因与基因组.ppt

SNP研究的意义：(1)进行疾病的遗传连锁分析(linkageanalysis)及关联分析(associationanalysis)，用于疾病易感基因定位;(2)在药物基因组学(pharmacogenomics)研究中，可通过检测SNPs的遗传多态性标记揭示人群中不同个体对不同药物的敏感性差异的根本原因。如多药耐药蛋白(MDR)、P-糖蛋白(P-gp)、有机阴离子转运体(OAT)等。第63页，讲稿共78页，2023年5月2日，星期三第五节人类基因组计划Section5HumanGenomeProject第64页，讲稿共78页，2023年5月2日，星期三2000年6月26日，美国、英国、法国、德国、日本和中国六国科学家同时向世界宣布人类基因组工作草图基本完成，绘制出人体97%的基因组，基中85%的基因组序列得到了精确测定，包含了人体约30亿个碱基对的正确排序。第65页，讲稿共78页，2023年5月2日，星期三一、人类基因组计划的由来与进展◆提出：由美国生物学家，诺贝尔奖获得者杜尔贝科(R.Dulbecco)于1986年在美国《科学》杂志上发表的一篇文章中提出。◆主要目标：测出人类基因组DNA长达3×109碱基对的序列，发现所有人类基因并阐明其在染色体上的位置，从而在整体上破译人类遗传信息。◆HGP还包括对一系列模式生物体基因组的全序列测定，如大肠杆菌、酵母、拟南芥、线虫、果蝇和小鼠等。第66页，讲稿共78页，2023年5月2日，星期三◆美国政府于1990年10月正式启动了这项将耗资30亿美元、为期15年的计划，预期在2005年完成人类基因组全部序列的测定。◆英国、日本、法国、德国的科学家先后加盟，遂扩展成国际性合作计划，并于1996年举行了国际合作的人类基因组大规模测序战略会议。◆1997年美国国立卫生研究院成立国家人类基因组研究所(NHGRI)。第67页，讲稿共78页，2023年5月2日，星期三细胞中质粒的不同形态第31页，讲稿共78页，2023年5月2日，星期三2.质粒的特性①常含有特殊基因：如抗生素的抗性基因②有复制起始区：能自主复制③可与宿主染色体整合：随宿主染色体同步复制④可遗传：细胞分裂时，可传递给子代⑤可转移：由一个细胞转移到另一个细胞⑥大小不定：小的约有1kb，大的可达250kb⑦拷贝数不定：严紧型(stringent)和松弛型(relaxed)⑧不相容性(plasmidincompatibility)：有些质粒不能共存于一个细菌的细胞内第32页，讲稿共78页，2023年5月2日，星期三②致育因子(Fertility(F)plasmids)通过接合在供体和受体间传递遗传物质。F因子：可以合成和装配性纤毛；重组区：有多个插入序列复制区：oriV和oriT3.质粒类型①抗性质粒(Resistance(R)plasmids)通常是一些抗生素抗性基因，如KanR，AmpR等。第33页，讲稿共78页，2023年5月2日，星期三通过F因子性纤毛在两个细菌细胞间转移DNA第34页，讲稿共78页，2023年5月2日，星期三③Col质粒编码大肠杆菌素(colicins)，可杀死其它细菌。如E.coli中的ColE1。④降解质粒(degradativeplasmids)可使宿主代谢特殊分子，如甲苯或水杨酸等。⑤侵入性质粒(virulenceplasmids)使宿主菌具有致病能力，如Ti质粒，Ri质粒等。第35页，讲稿共78页，2023年5月2日，星期三三、转座因子(transposableelements)1.转座因子概念是指DNA分子中不依靠同源性重组也能移动位置的DNA节段。已知转座因子的大小为750-40000bp。2.分类(1)插入序列(insertionsequence，IS)编码转位酶(transposase)，可含有启动子。(2)转座子(transposon，Tn)含有一到几个基因，编码抗药性或毒素基因。第36页，讲稿共78页，2023年5月2日，星期三转座子的结构图解(两侧的IS组件可以同向或反向，可以相同或不同)第37页，讲稿共78页，2023年5月2日，星期三第四节真核基因组Se