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凝胶成像及QuantityOne中文操作说明(1)
集团标准化办公室:
集团标准化办公室:[VV986T-J682P28-JP266L8-68PNN]
凝胶成像及QuantityOne中文操作说明(1)全文共1页,当前为第1页。凝胶成像及QuantityOne中文操作说明
凝胶成像及QuantityOne中文操作说明(1)全文共1页,当前为第1页。
第一章简介
凝胶电泳是每个做分子生物学的研究者天天都要打交道的基本技术。电泳之后的信息处理与电泳本身同样重要。目前有大量软件可以用于分析电泳结果,要向大家介绍的是Bio-Rad公司的1D凝胶分析软件QuantityOne(Bio-Rad还有一个做2D凝胶分析的软件PDQuest)。QuantityOne软件是常用1D凝胶分析软件中功能最强大,自动化程度最高的软件。这个软件的最新版本可以在Bio-Rad的网()免费下载,以供试用或用户升级之用。
QuantityOne软件的主要功能包括定量分析(VolumesQuickGuide),电泳条带分析(BandAnalysis),差显分析(DifferentialDisplayAnalysis),克隆计数(ColonyCountingAnalysis)等,此外,还可以直接控制Bio-Rad公司的各类图像仪和ExQuest自动切胶仪,使您的凝胶分析工作变得极为轻松。
QuantityOne软件拥有与windows操作系统下绝大多数应用软件相同的友好界面。
凝胶成像及QuantityOne中文操作说明(1)全文共2页,当前为第2页。插入密码狗,打开QuantityOne软件,可以看到最上缘蓝色横条幅是标题栏,往下依次是菜单栏和工具栏。
凝胶成像及QuantityOne中文操作说明(1)全文共2页,当前为第2页。
File
图像打开、保存、引入、打印等操作
Match
分子量估算、条带匹配分析
Edit
图像普通编辑操作
Volumn
定量分析
View
图像缩放、三维视图、看光密度值等操作
Analysis
浓度估算、克隆计数等分析
Image
图像旋转、翻转、裁切等操作
Reports
分析结果输出
Lane
泳道分析
Window
窗口分析
Band
条带分析
Help
帮助、快捷菜单、软件注册等
每个菜单的主要功能如下:
往下一行是工具栏,上面每个按钮的功能见下表:
QuantityOne软件HelpàQuickGuide快捷指南提示如何实现一个功能,如定量分析(VolumesQuickGuide),电泳条带分析(BandAnalysis),差显分析(DifferentialDisplayAnalysis),克隆计数(ColonyCountingAnalysis)等。快捷指南下有1,2,3…步骤,根据提示完成。
凝胶成像及QuantityOne中文操作说明(1)全文共3页,当前为第3页。使用QuantityOne软件进行电泳结果分析,通常包括图像获取、图像预处理、分析、结果输出四部分。图像获取就是通过软件控制扫描仪(GS-800、PharosFX等)或凝胶成像系统(GelDoc、ChemiDoc、VersaDoc等),图像预处理就是将扫描或拍照获得的原始图像进行初步处理,以便更好地进行后续分析。接下来是分析过程,根据分析的方法和目的不同,又可以分为定量分析、条带分析、克隆计数、差异(聚类)分析等等。不管如何分析,最终我们都必须通过软件的输出功能,得到我们想要的结果。QuantityOne软件提供了多种结果输出方式。在接下来的几章里,我们将按照这个思路,一步步引导您使用这一软件。
凝胶成像及QuantityOne中文操作说明(1)全文共3页,当前为第3页。
第二章图像获取
QuantityOne-版本可以控制Bio-Rad目前几乎所有的图像仪,如GelDocXR、ChemiDocXRS等。这些图像仪采集到的图像,可以直接保存成软件可直接分析的图像,即扩展名1sc的原始图像文件。下面将具体介绍如何通过QuantityOne软件从GelDocXR获取图像。
GelDocXR是Bio-Rad凝胶成像系统中最常用,操作最简便的仪器,它可以用来拍摄EB、SYBRGreen等染料染的核酸电泳凝胶;SyproRuby、银染、考马斯亮蓝等方法染的蛋白电泳凝胶;以及化学显色的印记膜等。
使用GelDocXR之前,先接通电源,打开位于仪器背面右下角的电源开关;然后根据具体的应用选择合适的照明和滤光片位置。原则如下:
表格形式
模式1.如果
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