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凝胶成像及QuantityOne中文操作说明

凝胶成像及Quaｎtity－One中文操作说明

凝胶成像及

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第一章简介

凝胶电泳是每个做分子生物学的研究者天天都要打交道的基本技术。电泳之后的信息处理与电泳本身同样重要。目前有大量软件可以用于分析电泳结果,要向大家介绍的是Bｉｏ-Rａd公司的1D凝胶分析软件QuaｎtityOｎe（Bｉo-Rａd还有一个做2D凝胶分析的软件PDQｕest）。QuantityＯnｅ软件是常用１D凝胶分析软件中功能最强大，自动化程度最高的软件。这个软件的最新版本可以在Ｂio-Ｒad的网(HYＰEＲLINK＂)免费下载，以供试用或用户升级之用。

QuａntityOnｅ软件的主要功能包括定量分析（VｏｌumesＱuickGuide),电泳条带分析(BandＡｎalｙsis)，差显分析(DifferｅnｔiaｌDisplａyAnaｌｙｓis),克隆计数(ColｏnyCouｎtｉngAnalｙsis)等，此外,还可以直接控制Bｉo－Rad公司的各类图像仪和ExＱuｅsｔ自动切胶仪,使您的凝胶分析工作变得极为轻松。

QｕａntitｙＯne软件拥有与ｗiｎdows操作系统下绝大多数应用软件相同的友好界面。

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File

图像打开、保存、引入、打印等操作

Ｍａtｃｈ

分子量估算、条带匹配分析

Eｄit

图像普通编辑操作

Vｏlumｎ

定量分析

Ｖiew

图像缩放、三维视图、看光密度值等操作

Analysis

浓度估算、克隆计数等分析

Ｉｍagｅ

图像旋转、翻转、裁切等操作

Rｅports

分析结果输出

Lａnｅ

泳道分析

Ｗｉnｄｏｗ

窗口分析

Baｎd

条带分析

Hｅlｐ

帮助、快捷菜单、软件注册等?????????

每个菜单的主要功能如下：

往下一行是工具栏，上面每个按钮的功能见下表:

QuanｔiｔyOnｅ软件ＨｅlｐàＱuｉckGuｉdｅ快捷指南提示如何实现一个功能,如定量分析(ＶｏlumesQuiｃkGuｉde）,电泳条带分析（ＢandAｎalysis)，差显分析(DifferｅntiaｌDiｓplayAnａlyｓｉｓ)，克隆计数（CｏlｏnyＣｏuntingAnalｙsｉs）等。快捷指南下有1,2，3…步骤，根据提示完成。

凝胶成像及QuantityOne中文操作说明全文共4页，当前为第4页。使用QｕantityOne软件进行电泳结果分析，通常包括图像获取、图像预处理、分析、结果输出四部分。图像获取就是通过软件控制扫描仪（ＧS－800、PharosFX等)或凝胶成像系统(GelDoｃ、CheｍiDoc、VersaDｏc等）,图像预处理就是将扫描或拍照获得的原始图像进行初步处理，以便更好地进行后续分析。接下来是分析过程,根据分析的方法和目的不同,又可以分为定量分析、条带分析、克隆计数、差异（聚类)分析等等。不管如何分析，最终我们都必须通过软件的输出功能,得到我们想要的结果。QｕａnｔityOne软件提供了多种结果输出方式。在接下来的几章里，我们将按照这个思路,

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第二章图像获取

QuantityOnｅ4.４－4.6版本可以控制Bio-Rａｄ目前几乎所有的图像仪,如GeｌDｏcＸR、CｈemｉDocXＲS等。这些图像仪采集到的图像,可以直接保存成软件可直接分析的图像,即扩展名1sｃ的原始图像文件。下面将具体介绍如何通过QｕantityOne软件从GelDocＸR获取图像。

GeｌDocXR是Ｂｉo-Rad凝胶成像系统中最常用,操作最简便的仪器,它可以用来拍摄ＥB、ＳYBRGreen等染料染的核酸电泳凝胶;ＳyｐｒｏＲubｙ、银染、考马斯亮蓝等方法染的蛋白电泳凝胶；以及化学显色的印记膜等。

使用GeｌDocXＲ之前,先接通电源,打开位于仪器背面右下角的电源开关;然后根据具体的应用选择合适的照明和滤光片位置。原则如下：

表格形式

模式1.如果样品是通过ＥB、ＳYBRGrｅen、SyproRuby等染料通过紫外激发来