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Reminder-Expression
Promotercodingregionendregion
5’IIII3’sense
3’IIII5’ense
mRNA5’II3’-sense
PolypeptideNH3^+COO^--
Studythisforafewminutes,thenputitaway
andanswerthefollowingquestions.
Exampleofbacterialpromoterregion
andstartsite
ThesequencebelowisthecodingstrandatthebeginningofanE.coligene,the
baseshavebeennumbered.
Canyouannotatethiswith
a)Thetranscriptionstartsite?
b)Labelwhatisupstreamandwhatisdownstream?
c)Thepromoterboxes?
5’3’
GTATTGACATTGATAGAAGCACTCTACTATATTCTCGC
ATGTCCACGGAT
-35-30-25-20-15-10-5-1/+1+5
+10
Exampleofbacterialpromoterregion
andstartsite
Transcription
startsite
GTATTGACATTGATAGAAGCACTCTACTATATTCTCGC
ATGTCCACGGAT
boxbox
-35-30-25-20-15-10-5-1/+1+5
or
upstreamdownstream
+10
Pribnow
box
Exampleofbacterialpromoterregion
andstartsite
Thistime,canyouturnthiscodingstrand(thesame
sequenceasbefore)intothebeginningofthemRNA
sequence?
5’3’
GTATTGACATTGATAGAAGCACTCTACTATATTCTCGC
ATGTCCACGGAT
-35-30-25-20-15-10-5-1/+1+5+10
Exampleofbacterialpromoterregion
andstartsite
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