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NIST检索简易教程
Nist?Search?(NIST?MS?Search?2.0)检索提供谱库检索,图谱解析,同位素计算等多种功能,对质谱检索及解析很有帮助,非常好的质谱工具。
一、启动NIST检索
1、从程序栏的NIST?Mass?Spectral?Database的MS?Search?v2.0进入Nist?Search
2、从安捷伦的工作站的DATA?ANALYSIS(数据分析)的Spectrum菜单的Nist?Search进入(要首先选某处的质谱图)
3、从Amdis导入
在Amdis的谱图上按鼠标右键,NIST?Library---Go?to?Nist?MS?Search?Program
NIST?MS?Search?2.0的界面:
二、NIST 谱库检索(Library Search)
1、未知物的检索
可以通过按鼠标右键进行有关切换。
这是NIST谱库与化学工作站链接进行检索的一种方式。其检索的匹配用正向和反向两种方法表示。
质谱数据库(MS Library):
主谱库(Mainlib),主要EI MS库,重建谱库(replib),保留指数库(nist ri),MS/MS谱库(nist msms),自建谱库等。
在NIST检索的结果里有Match(正检索匹配度,derect match), R . Match(逆检索匹配度,reverse Match)和Prob(概率, Probability)三个值。
其中Prob的值是从假定此化合物是在数据库中,以及仅仅依赖在命中列表中的邻近命中的差别得出。它从分析用主库(Mainlib)检索的结果与一组重建质谱图(在重建谱库给出)得出。
计算正向检索(标准库的峰与未知谱对照,看看谱库中是否存在与未知谱相同的参考谱图)的相似系数,即匹配概率或匹配率(匹配度)。计算反向检索(未知谱的峰与标准库对照,看看标准谱中的各质量峰是否出现在未知谱中。忽略在谱库不存在的未知谱上的峰。)的相似系数,即匹配概率或匹配率(匹配度)。
在NIST检索中匹配率最大为1000(相当PBM中100),最好的结果是999,无峰的谱图是0。一般讲,900或更高,极好匹配;800-900,良好匹配;700-800,尚可;低于600,差。
对正向检索来讲,任何峰只要在未知谱或标准谱中之一出现,都会降低匹配值。对反向检索而讲,任何峰只要在标准谱出现,而未知谱中没有,也会降低匹配值。
如果正向的匹配率低,反向的匹配率高,说明未知峰谱可能是混合物的谱图,或者本底干扰严重。
估计保留指数Estimated Kovats RI: Value:?(例如丙二醇?724?iu)是从化合物的化学结构自动估计而来,稍有参考价值。而后面的文献的RI值是比较准,具有参考价值。
2、通过化合物名称、CAS号、分子式,分子量,任一离子峰等信息检索
在Search菜单下选择:
例如输入化合物名称(Name)(EthylButyrate)
例如输入CAS No 683117-0
任一离子峰检索(Any Peaks Search)
选择要检索的离子及其丰度范围,按accept,Search:
三、NIST谱图解析(MS Interpreter)
从Tools菜单下选择Mass Spectrum Interpreter进入谱图解析,即可出现谱图解析窗口。
或者在结构式窗口点击右键,从下拉菜单中选择 send to mass spectrum interpreter ,即可出现谱图解析窗口。
或者从开始程序的MS Interpreter直接进入。
谱图解析窗口如下:
在下面的谱图上小红三角符号表示该化合物的分子量。拖动鼠标可以看到从分子峰到鼠标所在处丢失的质量数。点击鼠标则把该质量数标识出来。
在谱图上点击右键可以看到断裂的碎片及其质量数等信息。例如71质量离子。
在结构图上点击左键,可以看到断裂的碎片及其质量数(m/z, formula,loss,type等)。
四、同位素计算?(Isotope Calculator)
点击Tools/ Isotope Calculate出现同位素计算窗口。
输入化合物分子式即可得到相应的同位素丰度。例如输入C6H12O2,可以看到:
质量数 丰度? ? ? ?
116? ? 100.00
117? ? 6.91819
118? ? 0.60327
119? ? 0.03082
以及120,121同位素的丰度
可以点击在某一质量数上点击,就可以把这个质量数的丰度作为100,其它质量数与其进行比较计算出相当丰度。即Max值。
再举个例子:C3H12Br
可以在Option菜单或通过左边的工具栏选择进入其它功能。
例如选Formula Entry,在Formula中输入C6H12O2,则计算出分子量MW=116
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