手把手教你构建系统进化树课件.pptVIP

如何构建系统进化树;;MEGA是一个关于序列分析以及比较统计的软件。现主要介绍使用Mega 6.0构建系统进化树的方法。供大家参考。 用MEGA构建进化树有以下步骤： 1、测序： 将克隆扩增测序得到的基因进行测序。 2、NCBI上做Blast 比对找到相似度最高的几个基因，将这几个基因的序列（Fasta格式文件）下载下来，或点击GenBank登录号，复制FSATA格式，整合在一个*.txt文档中。 ;;手把手教你构建系统进化树;手把手教你构建系统进化树;以外米缀蛾的cds为例，点击cds，出现下图。;;点击FASTA，出现下图。;该图为外米缀蛾的FASTA格式，如何保存见下图;;因为我采取基于氨基酸序列比对，所以选择coding sequences和fasta protein，下载编码区氨基酸序列。;文件名未下载时不要更改，下下来之后再更改;将所有下载下来的fasta格式序列用记事本打开，集中到一个记事本里;MEGA6可以识别fasta格式文件。如图，将全部-基因.txt重命名为全部-基因.fasta;选择打开方式为MEGA6，打开全部-基因.fasta，自动跳出序列窗口 用ClustalW做多序列联配;手把手教你构建系统进化树;手把手教你构建系统进化树;以.meg格式保存结果;手把手教你构建系统进化树;回到MEGA主窗口 打开所保存的文件（.meg）;点击按钮打开文件窗口;显示保守位点 显示变异位点;回到MEGA主窗口构建进化树;选择Bootstrap检验;设定完成，点compute，开始计算得到进化树构建的结果。;双击文字，可以修改树枝后的名称，名称要么全部斜体，要么全部不斜体，无法只让拉丁文斜体;双击文字，可以修改树枝后的名称，名称要么全部斜体，要么全部不斜体，无法只让拉丁文斜体;;手把手教你构建系统进化树;;谢谢聆听！如何构建系统进化树;;MEGA是一个关于序列分析以及比较统计的软件。现主要介绍使用Mega 6.0构建系统进化树的方法。供大家参考。 用MEGA构建进化树有以下步骤： 1、测序： 将克隆扩增测序得到的基因进行测序。 2、NCBI上做Blast 比对找到相似度最高的几个基因，将这几个基因的序列（Fasta格式文件）下载下来，或点击GenBank登录号，复制FSATA格式，整合在一个*.txt文档中。 ;;手把手教你构建系统进化树;手把手教你构建系统进化树;以外米缀蛾的cds为例，点击cds，出现下图。;;点击FASTA，出现下图。;该图为外米缀蛾的FASTA格式，如何保存见下图;;因为我采取基于氨基酸序列比对，所以选择coding sequences和fasta protein，下载编码区氨基酸序列。;文件名未下载时不要更改，下下来之后再更改;将所有下载下来的fasta格式序列用记事本打开，集中到一个记事本里;MEGA6可以识别fasta格式文件。如图，将全部-基因.txt重命名为全部-基因.fasta;选择打开方式为MEGA6，打开全部-基因.fasta，自动跳出序列窗口 用ClustalW做多序列联配;手把手教你构建系统进化树;手把手教你构建系统进化树;以.meg格式保存结果;手把手教你构建系统进化树;回到MEGA主窗口 打开所保存的文件（.meg）;点击按钮打开文件窗口;显示保守位点 显示变异位点;回到MEGA主窗口构建进化树;选择Bootstrap检验;设定完成，点compute，开始计算得到进化树构建的结果。;双击文字，可以修改树枝后的名称，名称要么全部斜体，要么全部不斜体，无法只让拉丁文斜体;双击文字，可以修改树枝后的名称，名称要么全部斜体，要么全部不斜体，无法只让拉丁文斜体;;手把手教你构建系统进化树;;谢谢聆听！