SN_T 4714-2016DNA条形码数据库技术规范.pdf

SN中华人民共和国出入境检验检疫行业标准SN/T 4714—2016DNA条形码数据库技术规范Technical specification forDNA barcodes database2017-07-01实施2016-12~12 发布中华人民共和国发布国家质量监督检验检疫总局刮涂层查真优 中华人民共和国出人境检验检疫行业标准DNA条形码数据库技术规范SN/T 4714--2016中国标准出版社出版北京市朝阳区和平里西街甲2号（100029）北京市西城区三里河北街16号（100045）总编室：（010址 中国标准出版社秦皇岛印刷厂印刷*开本 880×1230 1/16印张 2.5字数 74千字2017年11月第一版2017年11月第一次印刷印数 1--500*书号：155066·2-32160 SN/T 4714-2016前言本标准按照GB/T1.1--2009给出的规则起草。本标准由国家认证认可监督管理委员会提出并归口。本标准起草单位：中国检验检疫科学研究院、国家质量监督检验检疫总局信息中心、中华人民共和国广东出人境检验检疫局、中国科学院微生物研究所。本标准主要起草人：蒋弘山、张燕平、雷荣、岳巧云、马骏、陈克、刘力。 SN/T 4714—2016DNA条形码数据库技术规范1 范围本标准规定了DNA条形码的分类代码、实体编码、属性数据的结构、数据库构建、运行与维护等技术规范。本标准适用于指导检疫性有害生物DNA条形码数据库建设及数据交换。2规范性引用文件下列文件对于本文件的应用是必不可少的。凡是注日期的引用文件，仅注日期的版本适用于本文件。凡是不注日期的引用文件，其最新版本（包括所有的修改单)适用于本文件。GB/T2260一2007　中华人民共和国行政区划代码SN/T4621医学媒介生物标本编码规范3术语和定义下列术语和定义适用于本文件。3.1DNA条形码DNA barcode生物体内能够代表该物种的、标准的、有足够变异的、易扩增的DNA特征片段。3.2候选基因 candidate genes使用DNA条形码进行物种鉴别时供选择的基因。理想的候选基因具有如下特点：种间遗传距离显著大于种内遗传距离，且重叠区小或无。常用的候选基因有线粒体细胞色素C氧化酶I亚基（COI)基因、rDNA ITS序列、质体 trnH一psbA序列、叶绿体 rbcL序列等。3.3聚合酶链式反应polymerase chain reaction PCR一种分子生物学技术，用于扩增特定的DNA片段。在该反应中，使用与目的DNA序列互补的寡核苷酸作为引物，进行多轮的DNA合成。其中包括DNA变性，引物退火和在聚合酶催化下的合成。3.4测序实验信息 sequencing run information测定DNA条码相关的包含PCR扩增引物、测序引物、实验流程、测序时间、测序机构、测序原始峰图等的信息。3.5凭证标本voucher specimen具完备的采集、鉴定信息（采集人、日期、地点、生境、鉴定人、种名等），用于物种复核、引证、溯源并永久保存的标本（或腊叶标本）。1 SN/T 4714—20163.6参考物质reference material某些具有确定含量或组分，在实际样品定量/定性测定中用作计算被测物质的组分含量的直接或间接的参照标准的一类物质。3.7标本图片 specimen photograph反映标本形态学信息的图片，包含宽度、高度、文件类型等信息。3.8taxonomy information分类学信息由林奈分类法界定的包括界、门、纲、目、科、属、种的分类学信息。3.9分布地点　distribution site包括经度、纬度、海拔的位置集合。3.10机构代码institution code用于唯一标识检疫系统内部机构或与检疫相关的组织机构的6位数字代码。3.11数据库database按照数据结构来组织、存储和管理数据的仓库。3.12 server服务器也称伺服器。通常指-一个管理资源并为用户提供服务的计算机软件，分为文件服务器、数据库服务器和应用程序服务器等。运行以上软件的计算机或计算机系统也被称为服务器。3.13DNA(deoxyribo Nucleic acid)脱氧核糖核酸。3.14CO I (cytochrome C oxidase I )线粒体细胞色素C氧化酶I亚基，为最常见的 DNA条形码基因。3.15ITS(internal transcribed spacer)核糖体转录间隔区，常作为植物的 DNA条形码基因。3.16BOLD (barcode of life data)生命条形码系统，总部设在加拿大的全球最大的DNA条形码数据库系统。3.17NCBI(national center for biote