生物化学教学一生化.pptx

生物化学教学一生化;第二章;第一节 概 述;;;;蛋白质结构上的多样性 决定其功能上的多样性;;;;;二.蛋白质的化学元素组成;这些元素在蛋白质中的组成百分比;;第二节 氨基酸 ;;;;;一. 氨基酸的一般结构特点; 这些氨基酸中，它们分子中的a-碳 （分子中第2个碳，Ca）结合着一个氨基 和一个酸性的羧基。 此外，Ca还结合着一个H原子和一个侧链基团（用R表示）。 每一种氨基酸的侧链基团R都是不同的。;;第23页/共121页;手性碳; 二.氨基酸的分类与结构 (1)根据氨基酸分子中所含氨基和羧基数目的不同，可将组成蛋白质的20种氨基酸分为三大类： ①中性氨基酸，分子中含一个氨基，一个羧基； ②酸性氨基酸，分子中含一个氨基，两个羧基； ③碱性氨基酸，分子中含一个羧基，两个氨基。 ; (2)根据侧链R基团极性性质分类 ①非极性R侧链氨基酸； ②在生理pH条件下，极性带电荷的氨基酸； ③在生理pH条件下，极性不带电荷的氨基酸。;;;;;三．蛋白质中不常见的氨基酸——修饰性氨基酸;;;;四．非蛋白质氨基酸;很多非蛋白质氨基酸的功能尚不很清楚;;非蛋白质氨基酸的一个代表——牛磺酸;;五. D-氨基酸研究进展;;D-氨基酸的存在与某些蛋白质的功能密切相关;六．氨基酸的一般性质;在可见光区氨基酸均无吸收;;;;第48页/共121页;;七．氨基酸的化学性质;1. 氨基酸的解离性质;; 2. 氨基酸的等电点;;第55页/共121页;设 K’是表观解离常数 K1’ 表示?-C上-COOH的表观解离常数, K2’表示?-C上-NH3+ 的表观解离常数。;氨基酸 pI 的计算;An acidic amino acid pI=(pK1+pKR)/2;A basic amino acid pI=(pKR+pK2)/2;第60页/共121页;3. 氨基酸的主要化学反应;;茚三酮反应;;;（2） （与）亚硝酸反应 ;;（3）与2，4-二硝基氟苯反应 ;;;（4）与苯异硫氰酸（PITC）的反应 ;;a-氨基和羧基参与及其它的反应（参考）;第三节　蛋白质的结构 ;;;一. 蛋白质的一级结构;(一) 肽键和肽链的结构;; 共价主链：由肽单位规则地重复排列而成。 ;(二)　肽的命名及结构;肽的命名一般根据其功能和来源进行;自然界中的肽有开链式结构和环状结构;???84页/共121页; ;? L-Leu-D-Phe-L-Pro-L-Val ? ? L-Orn L-Orn ? ? L-Val-L-Pro-D-Phe-L-Leu ? 短杆菌肽S(环十肽) ? 由细菌分泌的多肽，有时也都含有D-氨基酸和一些不常见氨基酸，如鸟氨酸（Ornithine, 缩写为 Orn）。 这些存在于自然界中的、具有特殊生理功能的（小）肽类，叫做生物活性肽。;;(三) 肽链表达式;(四) 蛋白质一级结构的测定（参考）;;1）样品必需纯（97%以上）； 2）知道蛋白质的分子量； 3）知道蛋白质由几个亚基组成； 4）测定蛋白质的氨基酸组成；并根据分子量计算每种氨基酸的个数。 5）测定水解液中的氨量，计算酰胺的含量。;（2）蛋白质一级结构的测定步骤： 1. 多肽链的拆分 2.测定蛋白质分子中多肽链的数目 3.二硫键的断裂 4.测定每条多肽链的氨基酸组成 5.分析多肽链的N-末端和C-末端。 6.肽链断裂成多个肽段 7.测定每个肽段的氨基酸顺序。 8.确定肽段在多肽链中的次序 9.确定原多肽链中二硫键的位置。;(1)多肽链的拆分 由多条多肽链组成的蛋白质分子，必须先进行拆分。 ; 几条多肽链借助非共价键连接在一起，称为寡聚蛋白质， 如，血红蛋白为四聚体，烯醇化酶为二聚体；可用8mol/L尿素或6mol/L盐酸胍处理，即可分开多肽链(亚基). ;(2)测定蛋白质分子中多肽链的数目 通过测定末端氨基酸残基的摩尔数与蛋白质分子量之间的关系，即可确定多肽链的数目。;(3)二硫键的断裂 几条多肽链通过二硫键交联在一起。可在可用8mol/L尿素或6