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常用中药的生物鉴定;常用中药的生物鉴定方法; 聚合酶链式反应 (Polymerase Chain Reaction),简称PCR,是一种分子生物学技术,用于放大特定的DNA片段。可看作生物体外的特殊DNA复制。; 少量DNA 样品快速扩增amplify技术。
(invented by Kary Mullis , won a Nobel Prize in Chemistry in 1993 );原 理; PCR 要 件
模板Template
引物 Primers:
Small pieces of DNA.
Made up of 15 to 30 bases.?
Binds the DNA at a specific region.
forward and reverse 正向和逆向
酶Enzyme:
Taq DNA polymerase
PCR核酸Nucleotides:
Substrate, four deoxyribonucleotides (A,C,G,T)
dNTP
;M;取出15 ul ;;;;Program
Denature 95°C 5 min
Denaturation变性:双链DNA模板在热作用下, 氢键断裂,形成单链DNA,一般加热至90-95℃, 30 sec
Annealing褪火:系统温度降低,引物与DNA模板结合,形成局部双链,55-70℃,固称其为褪火。 most important factor in the PCR ,45sec
Extension延???:在Taq酶的作用下,以dNTP为原料,从引物的5′端→3′端延伸,合成与模板互补的DNA链, 温度为70-75oC, 1.5 min
Final extension 72 °C, 5 min;;;;;;;;;;;;;2x106;优点:
need very small amount of sample;Factors affect to PCR
Mg +2 concentration,
Mg +2 ? specificity ?
0.1~5mmol/L Mg+2 预实验
Primer(引物) specificity
Degenerate primer ---to find the target gene in the closely related species
specificity ?, nonspecific products ?;Annealing Temperature
Too high no PCR product
Too low much nonspecific product
gradient Temp PCR machine
find the suitable Temp
Taq polymerase quality
Template(模板) DNA quality
; PCR产物鉴定
Agarose gel electrophoresis to check product
;第30页/共47页;After PCR amplification
Agarose gel electrophoresis to check product
1.5% agarose in 17 ml TAE ( 4mm thick)
5 ul product add 1 ul 6X loading dye mix
1Kb marker 2.5 ul
100 V run 25-30 min
EB stain 10 min(EB致癌物, 戴手套) ,
photograph;
1.5
1.0
0.5
0.2
;PCR的应用
1.detection genetically modification organism (GMO )检测转基因生物,找出特异的基因或片段
find specific gene or fragment (promoter)
2.uncultured microorganism
3.pathogen identification
4.detection insertion sequence (cloning)
;提取模板; 乌梢蛇为《中国药典》(2010版)一部收载的一种常用中药,来源于游蛇科动物乌梢蛇[Zaocys dhumnades(Cantor)]的干燥体。有祛风、通络、止痉之功效。用于风湿顽痹、麻木拘挛、半身不遂、抽搐痉挛、瘰疠恶疮。
商品流通中多以
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