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本发明公开了一种基于HPV整合的肿瘤新抗原预测方法,属于生物信息学技术领域。该方法包括以下步骤:S01,组装肿瘤样品转录本;S02,筛选样本HPV整合转录本;S03,翻译HPV整合转录本为多肽;S04,获取多肽短序列片段,并过滤人类正常蛋白质组中多肽;S05,样品人类白细胞抗原基因分型;S06,肽段亲和力预测、新抗原筛选。本发明得到的新抗原是HPV整合的结果,与疾病进展过程密切相关。本发明得到的新抗原来自于RNA测序数据,是细胞转录的结果,有更高的概率翻译产生蛋白质。
(19)中华人民共和国国家知识产权局
(12)发明专利申请
(10)申请公布号 CN 113362896 A
(43)申请公布日 2021.09.07
(21)申请号 202110696080.9
(22)申请日 2021.06.23
(71)申请人 深圳市新合生物医疗科技有限公司
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