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本公开提出了三维基因组Hi‑C数据中TAD嵌套结构检测方法及系统,包括:针对获取的低分辨率Hi‑C数据,进行双端测序并各自对比,根据对比结果进行合并并筛选有效配对后,用有效的配对构建接触矩阵;运用深度学习网络模型对低分辨率Hi‑C数据进行增强;利用原始低分辨率Hi‑C数据和增强后不同来源的Hi‑C数据,检测TAD嵌套结构。结合了数据增强和结构检测两部分功能,通过输入不同精度的Hi‑C实验数据,能够得到同样全面细致的TAD及其嵌套结构整体分析,在突破实验条件限制的同时降低了测序成本,提升了本方法可
(19)中华人民共和国国家知识产权局
(12)发明专利申请
(10)申请公布号 CN 113178230 A
(43)申请公布日 2021.07.27
(21)申请号 202110390522.7
(22)申请日 2021.04.12
(71)申请人 山东
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