分子标记的资料.pptxVIP

分子标记的资料;作物育种对农业的贡献;传统育种手段的不足;第一节.遗传标记;遗传标记的类型; 1. 形态标记(morphological markers)： 是指植物的外部形态特征，如矮秆、白化、黄化、变态叶、雄性不育等。广义上还包括色素、生理特征、生殖特性、抗虫抗病性等。 形态标记的获得 一般通过自然突变或物化诱变来获得具有特定形态特征的遗传标记材料，然后通过两点或三点连锁测定法确定标记基因与目标性状之间的关系。 通过不同标记基因材料之间的相互杂交，可以选择出具有多个标记基因的材料。;品系;普通玉米与高直链淀粉玉米籽粒形态; 形态标记的不足之处 （1）数量有限，而人工培育形态标记材料的周期长； （2）一些形态标记的多态性差，易受环境因素的影响； （3）一些形态标记对植株的表型影响太大，与不良性状连锁。 ;2. 细胞学标记(cytological markers)： 是指细胞内染色体的变化，包括染色体数目的变化(如单体、缺体、三体、四体 )或染色体结构的变异(如缺失、易位、倒位、重等 )。可通过染色体核型（染色体数目、大小、随体有无、着丝粒位置等）和带型（C、N、G等）分析来测定基因所在的染色体及相对位置，或通过染色体置换等进行基因的定位。; 细胞学标记的不足之处： （1）细胞学标记材料的选育需要花费大量的人力和较长的时间； （2）某些物种对染色体数目和结构变异反应敏感，有些则适应变异的能力差； （3）一些不涉及染色体数目、结构变异或带型变异的性状则难以用细胞学方法检测； （4）难以开展基因的精细定位。;3. 生化标记(biochemical markers) 主要包括贮藏蛋白、同工酶和等位酶等。种子中的贮藏蛋白主要包括白蛋白、球蛋白、醇溶蛋白和谷蛋白四种。不同植物种子中的贮藏蛋白含量不同。 生化标记的使用首次突破了把整株样品作为研究材料进行分析的方式，并可以直接反映基因产物的差异，受环境的影响较小。但标记数量远远不能满足实际的需要。; 同工酶(isozyme)：电泳所可区分的同一种酶（系统）的不同变化。 等位酶(allozyme)：由一个位点的不同等位基因编码的同种酶的不同类型，其功能相同但氨基酸序列不同??; 4. 分子标记 (molecular markers) 是指基因组DNA分子水平之间的差异。 优越性： （1）直接以DNA的形式表现； （2）数量多，遍及整个基因组，检测位点近乎无限； （3）多态性高，不需要专门创造特殊的遗传材料； （4）不影响目标性状的表达，与不良性状无必然的连锁； （5）有许多分子标记表现为共显性。;第二节 分子标记的主要类型及基本原理;;(二)PCR的基本原理;;PCR反应的基本过程;;(三) PCR反应体系的基本成分：;(四)PCR扩增产物的分析;琼脂糖凝胶电泳;;聚丙烯酰胺凝胶电泳;;一、以分子杂交为基础的DNA标记技术;二、以PCR为基础的DNA标记技术;三、其它类型的分子标记;四、显性标记和共显性标记;F1 P1 P2;F1 P1 P2;英文缩写 ;(二)RAPD标记;;五、分子标记的原理和遗传特性;(三)、SSR标记;(四)AFLP标记;对基因组DNA进行双酶切，在使用的两种限制性酶中，进一步将酶切片段和含有与其粘性末端相同的人工接头连接，连接后的接头序列及临近内切酶识别位点就作为以后PCR反应的引物结合位点，通过选择在末端上分别添加1-3个选择性碱基的不同引物，选择性地识别具有特异配对顺序的酶切片段与之结合，从而实现特异性扩增;; 第18章 分子标记辅助育种;五、SNP标记;SNP = Single Nucleotide Polymorphism ;第三节.分子标记辅助选择(MAS);分子标记辅助选择(MAS)的遗传基础; 对基因组中其他部分（即遗传背景）选择，称为背景选择（background selections）。背景选择的对象几乎包括了整个基因组，因此，这里牵涉到一个全基因组选择的问题，在分离群体中，由于在上一代形成配子时同源染色体之间会发生交换，因此每条染色体都可能是由双亲染色体重新组装的杂合体。 ;;二.分子标记的优越性; 目标基因的标记筛选（gene tagging）是进行分子标 记辅助选择（MAS）育种的基础。用于MAS育种的分子标 记须具备以下条件：;第三节 分子标记辅助选择(MAS)在作物遗传育种中的应用;(一) 遗传图谱的构建与重要农艺性状基因的标记; ae基因两侧SSR标记遗传连锁图谱 ;2 构建遗传图谱的主要环节; 构建遗传图谱，首先要选择合适的亲本及分离群体，而且亲本之间的差异不宜过大，否则会降低所建图谱的准确度和适用性。;用于分子标记的遗传作图可