NGS与感染性疾病PPT课件.pptx

NGS和感染性疾病的精准 治疗 贾平东 1| 2| 2003年完成了人类基因组计划 BIOLOGY PHYSIC 艺 aINGIS NFOR 3| 联合六个国家 1000位科学家 O该计 约意识 到人们 数据 分析俞 系列 生物学 耗时 预算 然而 O 30亿G10年不下的 测序 了解基 完成第一份完整的 因组 人类基因图谱！ 4| 下一代测序next-generation sequencing，NGS 02000年之后推出的高通量测 序平台很好地解决了这个问 题，人类基因组测序的成本 直接因此下降50000倍 o 产生了一个新的名词NGS 5| NGS是什么? 一传统的测序方式 大规模平行签名测序MassivelyParallelSignatureSequencing MPSS) 聚合酶克隆PolonySequencing、 454焦磷酸测序454pyrosequencing、 Illumina(Solexa)sequencing、 ABIsOLDsequencing、 离子半导体测序Ionsemiconductorsequencing、 等 DNA纳米球测序DNAnnoballsequencing| 二NGS(nextgeneration sequencing O包括二代的大规模平行测序和三代的单分子测 序。 高通量测序技术是对传统测序一次革命性的改 变，一次对几十万到几百万条DNA分子进行序 列测定 被称为下一代测序技术(nextgeneration seqencing)足见其划时代的改变| O 同时高通量测序使得对 个物种的转录组和基因组进 行细致全貌的分析成为可能 所以又被称为深度测序| 三测序平台 Ilumina公司的Solexa测序平台 1、 2 Roche公司的454测序平台 3、 ABI公司的寡核苷酸连接检测平台 (SOLiD| 四)NGS特点 o1、不同平台测序方法不同，但 原理有着共通之处，都是将基因 组DNA随机切割成小片段DNA 再通过构建文库、PCR扩增等技 术流程获得测序模板进行测序及 数据分析，相对于Sanger测序 来说通量高、速度快、费用低 10| 四NGS特点 o1、高准确性，高通量，高灵敏 度 02、可以同时完成传统基因组学 研究测序和注释以及功能基 因组学基因表达及调控，基因 研 功能，蛋白/核酸相互作用 究 11| 四NGS特点 o2、越来越多地应用第二代测序技术 菜 触决生物学。比如在因组 鲁 为遍实研学食种 都 糖 异的分学套础。 12| 全是厕3w.q4mjigcm n5-蹈| Tdm 天 生物无忧 1m| Evolution》 15| NGS可以为感染性疾病 做什么？ 16| 一)宏基因组学Metagenomics o又叫微生物环境基因组学、元基 因组学。 o它通过直接从环境样品中提取全 部微生物的DNA，构建宏基因组 文库，研究环境样品所包含的全 部微生物的遗传组成及具群落功 能 1o 17| 18 全跳网www.quanjng.co 3693| o对特定环境中全部微生物的 总DNA也称宏基因组 metagenomic进行克隆 并通过构建宏基因组文库和 筛选等手段获得新的生理活 性物质，通过系统学分析获 得该环境中微生物的遗传多 样性和分子生态学信息 19| o宏基因组学研究的对象是特定 环境中的总DA，不是某特定 的微生物或其细胞中的总DNA 不需要对微生物进行分离培养和 纯化，这对我们认识和利用 95%以上的未培养微生物提供 了一条新的途径。 20| 0不仅能够从整体上认识微生物 群落自身数量和组成结构，而且 可以认识微生物群落自身及其写 宿主之间的进化关系，研究不同 状态对微生物群落结构和功能的 影响，分析人类正常菌群和疾病 状态下的结构和功能特征。 21| 肠道微生物宏基因组学与人体 代谢、免疫等各方面联系紧密 已成为近年来热门的研究主题 肠道菌群和糖尿病、肥胖症等代 谢性疾病的关系被不断深入研究 对于药物和肠道微生物群落的相 互影响也在不断探索 22| 二精准医学 24| 1、第二届感染性疾病精准医学高峰论坛 感染性传染性疾病危害严重，精 准诊断是实现其精准防控的前提。 目前针对性使用抗生素是一个重大课 ，另外即时快速病原诊断、未知病 题 原鉴定、混合感染病原诊断、全病程 病原监测等问题都值得重视和研究。 25| TI VIV们ECSONMEDCINE NGS背景下的感染性疾 2018.6.16中国北京 主办单位中国医学科学院北京协 科学院病原生物学研究所中国医学科学院北 2 冻a蕉医学众流协会感染病专业安员会 协办单位国家卫生健康 第二结来性我奶精洁 医学高峰论坛 26 Cnr Li| NGS在感染性疾病 中的应用 27| oNGS技术应用于细菌感染检测 明确是