第二次转录组和蛋白组a-2015.pdfVIP

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转录组与蛋白组 选自Genomes 3 中心法则 Genome 问题 提出Genome Transcriptome Proteome 这种概念有什么意义? Genome = Transcriptome = Proteome ? ? 一、转录组 • 广义的概念:指特定时间和条件下某种 组织或细胞中所有的RNA。 • 狭义的概念:指特定时间和条件下某种 组织或细胞中所有的mRNA。 The RNA Content of the Cell A bacterium 0.05-0.10 pg RNA 6% of its total weight A mammalian cell 20-30 pg RNA 1% of the cell weight Total RNA 非编码RNA对应的 是非编码序列吗? Coding RNA Non-coding RNA 2-4% 96-98% Pre- pri-miRNA Pre- Pre- mRNA rRNA tRNA hnRNA pre-miRNA Others: lncRNA mRNA rRNA tRNA snRNA snoRNA miRNA piRNA 真核原核细胞共有 真核细胞特有 编码RNA messenger RNA (mRNA) 2% (1-5%) high abundant 100 genes 1,000copies/cell intermediate abundant 500 ~ 1,000 genes ~ 100-500 copies/cell low abundant 26,000 genes 1-5copies/cell 非编码RNA (non-coding RNAs) ribosomal RNA (rRNA) 占80-85% (5S, 18S, 28S) 与蛋白质组成核糖体,作为蛋白合成的场所 transfer RNA (tRNA ) 占10-15% 携带氨基酸到核糖体进行蛋白合成 Small nuclear R

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