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环介导等温扩增技术原理
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食品营养与检测专业教学资源库
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环介导等温扩增(Loop-mediated isothermal amplification ,简称LAMP)是利用4个特殊设计的引物和具有链置换活性的Bst DNA聚合酶,在恒温条件下特异、高效、快速地扩增DNA的新技术。
一
概念
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LAMP技术扩增基因的关键是设计出4条特异性的引物,从需要扩增的靶序列中选出F3c、F2c、F1c、B1、B2、B3 六个特定的区域
二
引物设计
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引物设计
针对靶基因的六个不同的区域,基于靶基因3’ 端的F3c、F2c和Flc区以及5’ 端的Bl、B2和B3区等6个不同的位点设计4种引物。
LAMP反应的开始阶段四条引物都被使用,但在循环阶段则只有内引物被使用。
FIP(Forward Inner Primer):上游内部引物,由F2区和F1C区域组成,F2区与靶基因3’端的F2c区域互补,F1C区与靶基因5’端的Flc区域序列相同。
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引物设计
F3引物:上游外部引物(Forward Outer Primer),由F3区组成,并与靶基因的F3c区域互补。
BIP引物:下游内部引物(Backward Inner Primer ),由B1C和B2区域组成,B2区与靶基因3’端的B2c区域互补,B1C域与靶基因5’端的Blc区域序列相同。
B3引物:下游外部引物(Backward Outer Primer ),由B3区域组成,和靶基因的B3c区域互补。
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LAMP反应引物与对应模板区域
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1.基本原理
2.引物设计
3.分步原理
三
基本原理
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1.基本原理
60—65℃是双链DNA复性及延伸的中间温度,DNA在65℃左右处于动态平衡状态。利用引物合成的DNA链取代模板互补链。
①扩增目的片段时依赖的是一种具有链置换特性的Bst DNA聚合酶
②需四条能够识别靶序列六个特异区域的引物
③LAMP法并不需要对双链DNA进行预变性及进行温度循环。
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1.起始阶段
2.扩增阶段
四
分步原理
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(1)内引物FIP的F2与其模板的互补序列F2c结合,在Bst DNA聚合酶作用下,从F2的3’末端开始启动DNA合成,合成一条以FIP为新的DNA单链并与模板链结合形成新的双链DNA。
1.起始阶段
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(2)以F3为起始合成的新链与模板链形成双链。而原合成的以FIP为起始的DNA单链被置换而脱离产生一单链DNA,其在5’末端F
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