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第六章 蛋白质合成
mRNA 有一系列密码子(Codons) ,这些密码子同氨酰-tRNA 的反密码子(AntiCodon)
相互作用,使相应的氨基酸掺入到肽链中。核糖体提供一个控制mRNA 与氨酰-tRNA 相互
作用的环境,它像一个沿着模板前进的移动工厂,快速地重复合成肽键的循环。氨酰-tRNA
以惊人的速度进出核糖体,卸载下氨基酸;延伸因子(Elongation factor)反复的与核糖体结
合、解离。在这些辅助因子(Accessory factors)的共同参与下核糖体才能够完成蛋白质合成
的全过程。
核糖体有一些活性中 ,其中每一个活性中心都由一组特定的蛋白质和核糖体 RNA
的一段区域共同组成。其中rRNA 对活性中 是必须的,它行使结构上的甚至是催化的功
能。一些催化功能需要蛋白质参与,但没有一种活性可以由独立的蛋白质或蛋白质组产生,
他们只有在核糖体中才能行使功能。
在核糖体的催化反应中有两种重要的信息。一些突变的表型表明核糖体中有些特定的
蛋白质及tRNA 中的一些特定的碱基参与了特定的反应。结构分析,包括直接改变核糖体
中的组分和为了解rRNA 的保守特点所做的比较,揭示了一些行使特定功能的组分的定位。
核糖体(Ribosome)的基本结构是保守的,但对于细菌、真核生物原生质体和细胞器来
说,核糖体的大小及核糖体中RNA 及蛋白质的比例都有很大的不同。图6.1 比较了细菌和
哺乳动物的核糖体,它们都是 RNA 比蛋白质多的核糖核蛋白颗粒。这种核糖体蛋白称
为r-蛋白质。
图6.1 核糖体就是既含蛋白质又 RNA(RNA 比 图6.2 细菌核糖体及其亚单位形 的电镜图。
蛋白多) 、能够解离为大小亚单位的一些大的核
糖蛋白颗粒。
细胞中每一个核糖体都是独立的。核糖体由两个亚单位组成,其中每一个亚单位又由
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rRNA 和一些小的蛋白质构成。大亚基也可能含有小的RNA 。在E. coli 中,小亚基(30S)
由16S RNA 和21 种蛋白质构成,大亚基(50S) 由23S rRNA ,小5S rRNA 和31 种蛋白质
构成。除其中一种蛋白质在每个核糖体中有四个拷贝外,其余的蛋白质都是每个核糖体一
个拷贝。
高等真核生物原生质体的核糖体比细菌的大。它的RNA 及蛋白质的总量都比细菌的
多;RNA 分子的长度更长(称为18S rRNA 和28S rRNA),蛋白质的量更多。很可能大多数
甚至全部蛋白质的 量甚微,RNA 在量上还是主要的组分。
细胞器核糖体同原生质体核糖体不同,并且有多种形式。在某些情况下,它们同细菌
核糖体大小相似,含有 70% RNA ;在另外一些情况下,它们只有 60S,含有小于30%的
RNA 。
在图6.2 中列出亚基及完整的细菌核糖体的电镜照片,以及对应的方向的模型。完整
的70S 核糖体具有不对称结构。小亚基头部和身体的分隔区同大亚基的沟排列在一起,使
小亚基的平面伸入到大亚基中。在两个含有很多重要位点的亚基之间形成一个空洞。
RNA 是构成细菌核糖体的主要组分,它们遍布于整个核糖体中,很可能大多数甚至全
部蛋白质都与之接触。所以rRNA 被认为是构成每个亚基的骨架,决定整个核糖体的结构
及核糖体蛋白的定位。
6.1 蛋白质合成的步骤
核糖体中每一个亚基在蛋白质合成中都行使专一的功能。信使 RNA 同小亚基结合,
结合位点在前30 个碱基上。现在普遍认为mRNA 位于或接近于两个亚基的结合部位。在
蛋白质合成的每次循环反应中都有两个t
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