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. . . . . . 因为bTMB的作用开始得到了一定程度的认可,我相信目前在国内也有很多家厂商开始提供bTMB的检测了。但是作为一个在测序和生信分析老司机,笔者还是有必要提醒一下。要想获得靠谱的bTMB,在测序中一定要使用双端样本index (即UDI,针对Illumina平台),否则你将无法排除Index Misassignment带来的样本间污染导致的大量假阳性超低频突变。同时,还需要使用UMI分子标签方法,以排除PCR, 和测序过程中带来的大量错误。 * . 《柳叶刀·呼吸医学》就发表了一篇新的文章,表示DNA甲基化可能成为PD-1免疫治疗最新预测标志物。该研究通过肿瘤组织DNA的甲基化芯片分析,发现了301个CpG岛的甲基化水平与非小细胞肺癌患者接受PD-1阻断治疗的临床响应显著相关。而基于这301个CpG岛甲基化水平组合而成的EPIMMUNE特征,则是无进展生存率 (PFS)和整体生存率 (OS)的独立预测指标,见下图。 * . 此外,近期一项大型基因分析发现,在肺癌中携带下述基因变异的病友,更容易TMB高,这些基因分别是:RRM1,TP53,FANCE,NEIL1 ,POLE ,POLG, FANCE, GEN1, RPA1——赶紧回去翻翻自己的基因检测报告,看看有没有上述幸运基因吧。 POLE基因突变的患者使用PD-1抗体治疗 非小细胞肺癌 2016年,权威的学术期刊《Science》 发表了纽约长老会和哥伦比亚大学的研究成果:科学家对34位使用PD-1抗体的非小细胞肺癌患者进行全外显子基因测序,在这些患者中,有两位患者的POLE基因有问题:一位患者肿瘤明显缩小,达到PR水平,无进展生存期高达14个月;另外一位患者肿瘤稳定不进展,达到SD的水平,PFS有8个月。最终也发现基因突变数多的患者更容易从PD-1抗体治疗中获益 子宫内膜癌 该患者53岁时被确诊为子宫内膜癌,有淋巴血管和肌层侵犯。家族两个兄弟在55和67岁确诊前列腺癌,父亲是脑瘤,姨妈在50多岁的时候确诊肠癌和淋巴瘤。这位患者的基因大概率会有问题,家人患癌的概率太高了。 患者首先接受了放疗,随后腹膜复发,然后进行了放化疗的联合治疗,化疗药物包括多柔比星+紫杉醇+铂类。两年之后,肿瘤锁骨转移,腹膜和腹部淋巴结肿大,包裹下腔静脉,很快患者出现了下肢水肿,生活质量受到严重的影响。 放疗和化疗都做了,子宫内膜癌又没啥子好的靶向药,咋办呢?参加临床试验吧,国外患者参加临床试验的积极性挺高。刚好碰上了默沙东的PD-1抗体的临床试验招人,碰碰运气喽。 接下来,患者进行了PD-L1检测,阳性,入组了临床试验,使用剂量10mg/kg,2周一次。这个剂量非常“壕”,如果不是临床试验,一个月至少得30万大洋。 奇迹出现了:8周之后,肿瘤明显缩小,达到部分缓解的水平,持续有效至少14个月(截止文章发表,依然有效)。患者的副作用很小,只有轻微的皮疹、肝功异常和发烧。 因此POLE突变基因是个热点分子,有望在肿瘤治疗中取得杰出的成果!肿瘤患者的个性化治疗越来越重要。基因测序给我们带来巨大的数据,如何根据患者的身体状况、治疗经历和遗传历史等情况制定个性化的治疗方案是值得所有人思考的问题。比如这个POLE基因,或许以后还会关系到PD-1治疗效果的A-B-C-D-E基因。 * . . * . Folfirinox (FFX) and Nab-paclitaxel/Gemcitabine (AG) showed significant efficacy improvement compared to Gemcitabine alone in metastatic pancreatic cancer (mPC). Alternating AG and FFX may overcome resistance and delay tumor progression. We designed a multicenter phase I-II trial to evaluate a sequential treatment with AG followed by FFX in 1st-line. Phase I established the recommended doses and confirmed the feasibility in a 12-patient expansion cohort (Assenat et al, ESMO 2016). Phase II assessed the efficacy of the recommended doses. * . Methods: During phase II, AG and FFX were administered s
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