火龙果转录组测序基因表达与功能分析-植物科学学报.pdf

植物科学学报　 ２０１９ꎬ３７(２):１９８~２１０ Ｐｌａｎｔ ＳｃｉｅｎｃｅＪｏｕｒｎａｌ ｈｔｔｐ:// ｗｗｗ.ｐｌａｎｔｓｃｉｅｎｃｅ.ｃｎ － 魏开发ꎬ李艺宣.火龙果转录组测序、基因表达与功能分析[Ｊ].植物科学学报ꎬ２０１９ꎬ３７(２):１９８ ２１０ Ｗｅｉ ＫＦꎬＬｉＹＸ. Ｄｅ ｎｏｖｏ ａｓｓｅｍｂｌｙ ａｎｄ ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｏｍｅ ａｎａｌｙｓｉｓ ｏｆ Ｈｙｌｏｃｅｒｅｕｓ ｕｎｄｕｌａｔｕｓ ｄｕｒｉｎｇ ｄｅｖｅｌｏｐｍｅｎｔ[Ｊ]. Ｐｌａｎｔ Ｓｃｉｅｎｃｅ Ｊｏｕｒｎａｌꎬ － ２０１９ꎬ３７(２):１９８ ２１０ 火龙果转录组测序、基因表达与功能分析 ∗ 魏开发 ꎬ 李艺宣 (闽南师范大学生物科学与技术学院ꎬ 福建漳州 ３６３０００) 摘　 要:利用高通量测序技术对火龙果(Ｈｙｌｏｃｅｒｅｕｓ ｕｎｄｕｌａｔｕｓ Ｂｒｉｔｔ)红肉品种‘大红二号’的花芽、 果实和枝条不 同发育阶段的基因表达进行研究ꎮ 结果显示ꎬ 转录组测序共获得４６８６８ Ｇｂ原始数据(Ｒａｗ ｄａｔａ)ꎬ 从头组装获 得２３９ １５２条转录本和１６２５１９条 ｕｎｉｇｅｎｅꎬ 约５３７４％ 的ｕｎｉｇｅｎｅ得到注释ꎮ 分别在４３ ５０６条和 １６ ２５１条 ｕｎｉｇｅｎｅ 中检测到６００ ２８３个 ＳＮＰ位点和５６ １４７个 ＳＳＲ位点ꎮ 基因表达分析结果表明ꎬ 在火龙果不同组织 Ｆｌ５１０、 Ｆｌ５１３、 Ｆｌ５１４、 Ｆｌ５１８、 Ｆ７１１、 Ｆ７１５、 Ｓ５１３、 Ｓ４１９ 中分别有３１、 ７、 ５、 １５２、 １７、 ６３、 １７、 ８个特异表 达的ｕｎｉｇｅｎｅꎮ 通过ＧＯ和ＫＥＧＧ富集分析ꎬ 发现了一些组织特异的ＧＯ条目和代谢通路ꎬ 如在Ｆｌ５１０ 中富集的 类萜骨架生物合成代谢通路等ꎮ 本研究还对参与花发育的候选基因进行了鉴定和表达分析ꎬ 他们包括 ＣＯＬ基 因、 ＦＴ￣ｌｉｋｅ基因、 分生组织决定基因和器官决定基因等ꎮ 关键词:火龙果ꎻ 转录组测序ꎻ 生长ꎻ花发育ꎻ 基因表达 中图分类号:Ｑ９４３２　 　 　 　 　 　 　 文献标识码:Ａ 文章编号:２０９５￣０８３７(２０１９)０２￣０１９８￣１３ － ＤＯＩ:１０１１９１３/ ＰＳＪ２０９５ ０８３７２０１９２０１９８ 开放科学(资源服务)标识码(ＯＳＩＤ): Ｄｅ ｎｏｖｏａｓｓｅｍｂｌｙ ａｎｄ ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｏｍｅ ａｎａｌｙｓｉｓ ｏｆ Ｈｙｌｏｃｅｒｅｕｓ ｕｎｄｕｌａｔｕｓ ｄｕｒｉｎｇ ｄｅｖｅｌｏｐｍｅｎｔ ∗ Ｗｅｉ Ｋａｉ￣Ｆａ ꎬＬｉＹｉ￣Ｘｕａｎ (Ｓｃｈｏｏｌ ｏｆ Ｂｉｏｌｏｇｉｃａｌ Ｓｃｉｅｎｃｅｓ ａｎｄ ＢｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙꎬＭｉｎｎａｎ Ｎｏｒｍａｌ ＵｎｉｖｅｒｓｉｔｙꎬＺｈａｎｇｚｈｏｕꎬＦｕｊｉａｎ３６３０００ꎬＣｈｉｎａ) Ａｂｓｔｒａｃｔ: Ｈｉｇｈ￣ｔｈｒｏｕｇｈｐｕｔ ｓｅｑｕｅｎｃｉｎｇ ｗａｓ ｕｓｅｄ ｔｏ ａｎａｌｙｚｅ ｔｈｅ ｇｅｎｅ ｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎ ｏｆ ｔｈｅ ｒｅｐｒｏｄｕｃｔｉｖｅ ｂｕｄｓꎬｆｒｕｉｔｓꎬ ａｎｄ ｓｈｏｏｔｓ ｏｆ Ｈｙｌｏｃｅｒｅｕｓ ｕｎｄｕｌａｔｕｓ Ｂｒｉｔｔ ‘Ｄａｈｏｎｇ２’ ａｔ ｄｉｆｆｅｒｅｎｔ ｄｅｖｅｌｏｐｍｅｎｔａｌ ｓｔａｇｅｓ. Ｉｎ ｔｏｔａｌꎬ ４６８６８ Ｇｂ ｏｆ ｒａｗ ｄ