猪2、7和8号染色体上影响血常规指标数量性状基因座(QTL)检测.pdf

■= P—1] 》… Ⅵ，、)nv．pibb．ac．crl 猪 2、7和 8号染色体上影响血常规指标的 数量性状基因座(QTL)检测 术 巩元芳 ， 卢 昕 王志鹏 ’李 珊 ’邱小田 张 勤1)．· ()农业生物技术国家重点实验室，农业部畜禽遗传育种重点开放实验室，中国农业大学动物科技学院，北京 100193； 河北科技师范学院动物科学系，昌黎 066600) 摘要 以3个品种(长 白猪、大白猪、松辽黑猪)16个公猪家系共计368头仔猪组成资源群体，在猪2、7和 8号染色体上共 选取 35个微卫星标记，采用基于线性混合模型的方差组分分析方法，对影响与猪 白细胞、红细胞和血小板相关的共计 l8项 血常规指标的数量性状基因座 (quanfi~tivetraitloci，QTL)进行了检测．通过似然比检验，并以自由度为2的卡方分布作为检 验统计量的分布，共发现22个在P5％水平下显著的QTL，其中在2号染色体上有9个，分别影响白细胞总数、中性粒细 胞数、平均红细胞体积、血红蛋白含量、平均红细胞血红蛋白浓度、血小板总数、平均血小板体积、血小板分布宽度和血小 板压积，在 7号染色体有7个，分别影响白细胞总数、中性粒细胞数、平均红细胞血红蛋白浓度、血红蛋白含量、血小板总 数、平均红细胞体积和红细胞分布宽度变异，在8号染色体上有6个，分别影响中性粒细胞百分比、淋巴细胞百分比、平均 红细胞血红蛋 白浓度、血小板总数、血小板压积和平均红细胞体积．为尽可能地避免由于多重检验所造成的假阳性率的升 高，我们采用了控制假检出率(falsediscoveryrate，FDR)的方法来对这22个QTL进行进一步检验，发现有 14个达到FDR 5％显著水平，其中又有9个达到FDR1％显著水平． 关键词 猪，血常规指标，数量性状基因座(QTL)，方差组分分析，假检出率(FDR) 学科分类号 $828．2 疾病，尤其是传染性疾病，是影响养猪生产效 如何降低疾病的危害，即通过抗病育种从遗传上提 率和食品安全的重要因素．在过去的几十年中，猪 高猪只个体对传染性疾病的抵抗能力．动物对传染 的生产性能有了大幅度 的提高，但是，传染性疾病 性疾病的抗病性分为先天性免疫和获得性免疫两个 对养猪业的威胁和危害却并没有减弱，相反，还有 方面，对多数传染性疾病来说，个体的抵抗能力是 越来越严重的趋势．疾病对养猪业的危害是多方面 先天性免疫和获得性免疫共同作用的结果．而无论 的，它不仅造成猪只死亡、生产性能降低、生产成 先天性免疫还是获得性免疫都或多或少受其遗传基 本增加、遗传改 良速度受阻等等，还严重影响食品 因的控制．有些抗病性是由单基因控制的，但对大 安全，威胁人类健康．长期以来，人们主要从两个 多数疾病，尤其是传染性疾病，抗病性是由多个基 方面采取措施来减少疾病所造成的危害，一是改善 因共同影响的，而其中有些个别基因(QTL或主效 环境条件 ，减少病原体的传播途径，二是进行药物 基因)会起着较大的作用，因此，对这些单基因或 预防和治疗．但是这些措施并不是总能奏效或效果 有限．近年来，由于消费者对药物残留所导致的食 品安全问题越来越重视，药物预防和治疗措施受到 国家重点基础研究发展计划资助项 目(2006CB1021041 +通讯联系人 ． 了很大的限制．另一方面 由于病原微生物的抗药性 Tel：010E—mail：qzhang@cau．edu．cn 的增强和变异性的增加，药物预防和治疗的难度越 收稿 日期：2008—03—18，接受 日期：2008—08—05 来越大．这迫使人们越来越多地从另一