- 1、本文档共2页,可阅读全部内容。
- 2、原创力文档(book118)网站文档一经付费(服务费),不意味着购买了该文档的版权,仅供个人/单位学习、研究之用,不得用于商业用途,未经授权,严禁复制、发行、汇编、翻译或者网络传播等,侵权必究。
- 3、本站所有内容均由合作方或网友上传,本站不对文档的完整性、权威性及其观点立场正确性做任何保证或承诺!文档内容仅供研究参考,付费前请自行鉴别。如您付费,意味着您自己接受本站规则且自行承担风险,本站不退款、不进行额外附加服务;查看《如何避免下载的几个坑》。如果您已付费下载过本站文档,您可以点击 这里二次下载。
- 4、如文档侵犯商业秘密、侵犯著作权、侵犯人身权等,请点击“版权申诉”(推荐),也可以打举报电话:400-050-0827(电话支持时间:9:00-18:30)。
- 5、该文档为VIP文档,如果想要下载,成为VIP会员后,下载免费。
- 6、成为VIP后,下载本文档将扣除1次下载权益。下载后,不支持退款、换文档。如有疑问请联系我们。
- 7、成为VIP后,您将拥有八大权益,权益包括:VIP文档下载权益、阅读免打扰、文档格式转换、高级专利检索、专属身份标志、高级客服、多端互通、版权登记。
- 8、VIP文档为合作方或网友上传,每下载1次, 网站将根据用户上传文档的质量评分、类型等,对文档贡献者给予高额补贴、流量扶持。如果你也想贡献VIP文档。上传文档
查看更多
实用生物信息技术课程第2次作业UniProt数据库高级检索及数据条目
实用生物信息技术课程第2次作业
PAGE \* MERGEFORMAT 2
UniProt数据库高级检索及数据条目注释信息
姓名________ 学号______________ 编号_____ 日期________
人珠蛋白家族检索
写出从UniProt数据库中检索已审阅的人珠蛋白(globin)家族12个亚基的步骤。
列表说明这12个珠蛋白的登录号、蛋白质名称、和序列长度。
与血红蛋白alpha亚基差异最大的序列是哪个?相同位点百分比?
与血红蛋白beta亚基差异最小的序列是哪个?差异位点共多少个?
列表说明从UniProt数据库中检索以下序列条目的步骤和结果:
所有拟南芥序列
已审阅拟南芥序列
已审阅拟南芥序列中具有蛋白质证据的序列
已审阅拟南芥序列中具有蛋白质证据、且具有跨膜螺旋的序列
已审阅拟南芥序列中具有蛋白质证据、具有跨膜螺旋和信号肽的序列
已审阅拟南芥序列中具有蛋白质证据、具有跨膜螺旋和信号肽、并具有二硫键的序列
已审阅拟南芥序列中具有蛋白质证据、具有跨膜螺旋、信号肽、二硫键,且已经测定三维结构的序列
课题相关蛋白检索
UniProt数据库中与你研究课题相关的物种共有多少序列条目
其中已审阅的序列条目有多少
上述已审阅的序列条目中具有蛋白质证据的有多少
上述具有蛋白质证据的条目中与你们实验室研究方向相关的有多少
上述具有与你们实验室研究方向相关的序列中与你课题相关的有多少
血红蛋白注释信息(请在认真查看注释信息基础上用中文总结,不要用屏幕拷贝)
以人血红蛋白alpha亚基为例,说明该序列条目包括几类相关文献。
以人血红蛋白alpha亚基为例,说明该序列条目包括几类注释信息。
以人血红蛋白alpha亚基为例,说明该序列条目包括哪些特征位点信息。
以人血红蛋白alpha亚基为例,说明该序列条目包括哪几类数据库交叉链接,其中你最感兴趣的有哪些数据库。
豌豆内膜蛋白注释信息(请在认真查看注释信息基础上用中文总结,不要用屏幕拷贝)
以豌豆内膜蛋白PPF1_PEA为例,说明该序列条目包括哪些注释信息。
通过注释信息或高级检索,查找拟南芥中与PPF1_PEA属于同一家族的内膜蛋白。
通过查看注释信息和多序列比对,找出拟南芥中PPF1_PEA的直系同源蛋白ALB3_ARATH。
查看ALB3_ARATH的注释信息,特别是拟南芥专门数据库AraPort和TAIR,并与PPF1_PEA的注释信息进行比较,说明如何将模式生物研究结果用于非模式生物。
课题相关蛋白注释信息(请在认真查看注释信息基础上用中文总结,不要用屏幕拷贝)
以研究课题相关或你感兴趣的蛋白质为例,说明该序列条目包括几类相关文献。
以研究课题相关或你感兴趣的蛋白质为例,说明该序列条目包括几类注释信息。
以研究课题相关或你感兴趣的蛋白质为例,说明该序列条目包括哪些特征位点信息。
以研究课题相关或你感兴趣的蛋白质为例,说明该序列条目包括哪几类数据库交叉链接,其中你最感兴趣的有哪些数据库。
文档评论(0)