肿瘤研究分子生物学数据库资源.ppt

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2019-01-06 发布于浙江
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Promoter Coding sequences Promoter Coding sequences Promoter Coding sequences Deregulated gene Consequences of Balanced Chromosome Rearrangements IGH, IGK, IGL MYC Deregulated transcription ETV6/NTRK3 46 Fusion Genes in Benign and Malignant Soft Tissue Tumors 1992 1993 1994 1995 1996 1997 1998 1999 EWSR1/ATF1 FUS/DDIT3 PAX3/FOXO1A EWSR1/ERG EWSR1/WT1 PAX7/FOXO1A SS18/SSX2 EWSR1/NR4A3 HMGA2/LPP SS18/SSX1 EWSR1/DDIT3 EWSR1/ETV4 COL1A1/PDGFB EWSR1/FEV EWSR1/FLI1 2000 2001 2002 2003 2004 2005 2006 2007 HMGA2/LHFP SS18/SSX4 TAF15/NR4A3 COL1A2/PLAG1 EWSR1/ZNF278 FUS/ATF1 HAS2/PLAG1 TCF12/NR4A3 TPM3/ALK TPM4/ALK ASPSCR1/TFE3 CLTC/ALK LPP/C12ORF9 CARS/ALK HMGA2/CMKOR1 ATIC/ALK FUS/CREB3L2 FUS/ERG RANBP2/ALK SS18L1/SSX1 ACTB/GLI TGF/NR4A3 PAX3/NCOA1 FUS/CREB3L1 CIC/DUX4 COL6A3/CSF1 EWSR1/CREB1 HMGA2/EBF SEC31A/ALK EWSR1/SP3 1992 1993 1994 1995 1997 1998 2000 2001 2003 2004 2006 Ewing tumor Alveolar RMS, Clear cell sarcoma of soft tissue, Myxoid liposarcoma Desmoplastic small round cell tumor, Synovial sarcoma Extraskeletal myxoid chondrosarcoma, Lipoma Dermatofibrosarcoma protuberans Infantile fibrosarcoma AFH, Lipoblastoma, Inflammatory myofibroblastic tumor Alveolar soft part sarcoma Low grade fibromyxoid sarcoma, Soft tissue chondroma Pericytoma Tenosynovial giant cell tumor Soft Tissue Tumors with Specific Gene Fusions Frequencies of fusion genes in AML t(8;21)(q22;q22) RUNX1/RUNX1T1 4.3% t(15:17)(q22;q21) PML/RARA 4.1% der(11)(q23) MLL rearrangement 2.4% inv(16)(p13q22) CBFB/MYH11 2.3% t(9;22)(q34;q11) BCR/ABL1 0.7% inv(3)(q21q26) RPN1/EVI1 0.6% t(6;9)(p22;q34) DEK/NUP214 0.3% t(1;22)(p13;q13) RBM15/MKL1 0.2% t(8;16)(p11;p13) MYST3/CREBBP 0.1% t(7;11)(p15;p15) NUP98/HOXA genes 0.1% Deep Insight ExPASy (Expert Protein Analysis System)/ 综合的蛋白质分析工具网站大量、使用的蛋白质分析工具链