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2第2章基因组与基因组学—分子生物学检验技术
第一节 原核生物基因组 一、原核生物基因组特征 原核生物基因组DNA较小,一般在106~107bp之间 大肠杆菌基因组DNA由4.6×106 bp组成,是人类基因组3×109bp的1‰ 基因数目较少,约含3500个基因 原核生物基因组中只有一个DNA复制起点 多数是单拷贝基因,只有编码rRNA和tRNA的基因有多个拷贝,有利于核糖体的快速组装和蛋白质的急需合成。 原核生物结构基因的编码顺序一般不重叠。 质粒的理化性质 具有核酸分子的一般理化特性: 可嵌入某些染料 (溴化乙锭) 具有较强的抗切割和抗变性的能力 三、转座因子 1.插入序列(insertion sequence,IS) 一个转位酶基因两侧的反向重复序列, 长度为700 ~ 2 000bp。 三、转座因子 2.转座子(transposon,Tn) 具有转座酶基因、抗性基因,大小为 4500~20000bp。 三、转座因子 3.可转座的噬菌体(transposable phage) 具有转座功能的温和性噬菌体,能整合 到宿主基因组内。 三、转座因子 1.引起突变 转座可引起基因的多种突变 (插入失活、转录终止、缺失和倒位) 三、转座因子 2.引入新基因 某些抗生素的抗性基因 3.基因重排 产生具有新的生物学功能的蛋白质。 一、病毒基因组特征 2.基因组核酸类型 双链DNA;单链DNA 双链RNA;单链RNA 环状分子;线性分子 单链正链RNA病毒基因组可直接作为模板功能,翻译出所编码的蛋白质,并复制出病毒核酸,自我组装成为成熟的病毒颗粒,感染宿主细胞。 二、DNA病毒 第三节 真核生物基因组 第三节 真核生物基因组 真核生物的基因组比较庞大,不同生物种间差异很大,分为: 第三节 真核生物基因组 一、细胞核基因组及其特点 细胞核基因组的DNA与蛋白质结合形成染色体 除配子细胞外,体细胞有两个同源染色体,因此有两份同源的基因组 染色体位于细胞核内,是基因组遗传信息的载体 一、细胞核基因组及其特点 一、细胞核基因组及其特点 (一)单顺反子结构 (五)不连续复制 (二)断裂基因 (六)多态性 (三)重复序列 (七)基因重叠 (四)多基因家族与假基因 (八)端粒结构 一、细胞核基因组及其特点 真核细胞结构基因为单顺反子(monocistron) 一个结构基因经过转录生成一个单顺反子mRNA 分子,翻译成一条多肽链 一、细胞核基因组及其特点 真核细胞的基因为断裂基因(split gene) 基因组的大部分序列属于非编码区,不编码具有生物活性的蛋白质或多肽 编码区通常为结构基因,在两侧有非编码区,而且在基因内部也有许多不编码蛋白质的间隔序列 一、细胞核基因组及其特点 结构基因由内含子(intron)和外显子(exon)间隔排列组成。 内含子是非编码序列,在mRNA的成熟过程中被剪切,对外显子的正常表达可能具有调节作用。 外显子是编码序列,在mRNA成熟过程中切去内含子后拼接成完整的序列,成为成熟的mRNA指导蛋白质的生物合成。 一、细胞核基因组及其特点 2.间隔区DNA(spacer DNA) 真核生物基因之间的编码空白区或转录空 白区,一般位于单拷贝的结构基因之侧翼 。 基因组愈大,间隔区DNA所占的比例愈高 。 1.高度重复序列 分为反向(倒位)重复序列与卫星DNA 重复频率可达106以上 在基因组中所占比例随种属而异,约占10%~60%在人类基因组中约占20% 复性速率快,复杂度低 反向(倒位)重复序列 两个相同顺序的互补拷贝在同一DNA链上反 向排列而成 发夹式或“+”字形结构 回文结构 一、细胞核基因组及其特点 一、细胞核基因组及其特点 卫星DNA(satellite DNA) 一般由2~10bp组成,成串排列 碱基序列不同于其他部份,等密度梯度离心可将其与主体DNA分开 高度重复顺序的功能 参与复制水平的调节 参与基因表达的调控 参与转位作用 与进化有关 与个体特征有关 与染色体减数分裂时染色体配对有关 2.中度重复序列 重复数十~数万次(105) 复性速度快于单拷贝序列,但慢于高度重复序列 大多与单拷贝基因间隔排列,少数在基因组中成 串排列在一个区域 依据重复序列的长度可分为: 短分散片段、长分散片段 短分散片段 重复序列的平均长度为300bp(一般50
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