动物育种学_-第2章－数量遗传学基础教材教学课件.ppt

第二章 数量遗传学基础;第一节 数量性状的概念和特征;数量性状的概念 生物的性状基本上可分为两大类： 质量性状（qualitative trait） 变异可以截然区分为几种明显不同的类型，一般用语言来描述； 数量性状（quantitative trait） 个体间性状表现的差异只能用数量来区别，变异是连续的。;阈性状(threshold trait)：表现型呈非连续变异，与质量性状类似，但不是由单基因决定，性状具有一个潜在的连续型变量分布，遗传基础是多基因控制的，与数量性状类似。 数量性状的特征 区分性状的依据: 性状是描述性的，还是可以度量的； 性状是呈间断性分布，还是连续性分布； 性状的表现是否容易受到环境的影响； 控制性状的遗传基础是单基因还是多基因。;;第二节 数量性状遗传的多基因假说; 微效多基因假说（Nilsson-Ehle） 主要论点如下： 数量性状是由许多效应微小的基因控制； 这些微效基因的效应相等且相加，故又称累 加基因，在世代相传中服从孟德尔原理，即分离规律和自由组合规律，以及连锁互换规律； 这些基因间一般没有显隐性区别； 数量性状同时受到基因型和环境的作用，而且数量性状的表现对环境影响相当敏感。 假说的实质—数量性状由大量微效基因控制 ;;基因存在有三种不同的效应，即基因加性效应（additive effect）、等位基因间的显性效应（dominance effect）和非等位基因间的上位效应（epistatic effect) 。 可以将基因型值剖分为育种值（A）、显性效应偏差值（D）和上位效应偏差值（I）三个部分。D和I带有一定的随机性，一般均将它们归并到环境效应偏差值中，统称为剩余值，记为 R。 P=G+E=A+D+I+E=A+R （2.6） 假设Cov（A,R）=0 或 rAR=0 ;; 如果是在一个随机交配的大群体中，A1和A2的频率分别为 p 和 q ，那么群体的平均基因型值（ ）和基因型值方差（ ）为： 若定义A1和A2基因的平均效应值分别为 和， 则有： ;基因的平均效应 是指该基因随机地与群体内的配子结合，所形成的全部基因型均值与全群均值的离差?? 基因替代的平均效应 两种基因的平均效应值之差，反应了用一种基因取代另一种基因的群体均值变化，记为 ，即有： ; 由此可以得到各种基因型的加性效应值，即育种值（breeding value）等于构成该基因型的两个等位基因的平均效应之和，分别为： ;第三节 亲属间相关分析;亲属相关，有两类概念：一是亲属间的遗传相关 二是亲属间的表型相关。 亲属间的遗传相关 是从整体而言的，用亲属个体的基因来自共同祖先的概率计算，描述亲属间整体上的亲缘相关程度，与具体的性状没有关系。 亲属间的表型相关 是描述亲属间性状表型值间的相关系数，由于只有特定的数量性状才有表型值，因此这种相关在不同性状、不同群体都是有所不同的。;共同环境效应 母体效应（maternal effect） 在妊娠、哺乳等阶段由母体的营养水平、饲养管理、个体间差异等对后代造成的影响。 母体效应的影响分为两类： 母体效应造成后代与母亲表现的相似性增加； 母体效应造成同胞后代个体表现的相似性增加。;亲属间遗传协方差 造成亲属间遗传相关的根本原因是它们有共同来源的祖先 。 同源一致性（identity by descent，IBD） （Malécot，1948）：指亲属个体带有的基因是由某一共同祖先同一基因复制而来的 。 遗传协方差的实际构成比较复杂，在忽略上位效应和基因连锁时，它由一系列加性效应和显性效应以及各种互作效应构成，即：;;（2.12）;同样地： 因此， ， ，可以得到： 若X和Y为父系半同胞，则Φ=0。因此，对于半同胞有： ;亲 属;第四节 数量性状参数分析;定量描述数量性状遗传规律有三个最基本的遗传参数：重复力、遗传力和遗传相关 重复力（repeatability） 是衡量一个数量性状在同一个体多次度量值之间的相关程度的指标。 对性状的终身表现产生的影响有： 所有的基因效应 持久性环境效应 指时间上持久或空间上非局部效应的环境因素对个体性状