2007生物信息学进展.pdf

生命奥秘 2007生物信息学进展 历了2006年生物信息技术发展的风起云涌，变化万千。作为后继的一年，2007年的生物 经信息技术依然稳步地发展，它结合基因组学和蛋白组学，运用小分子RNA技术，促进疾 病基因相关研究，更在计算机相关技术中寻求创新，不断地向前迈进。 1. 基因组学成果辉煌 2005年12月，Solexa公司推出新型测序仪并提出了Solexa测序平台，发展快速测序技术，计划将哺乳动 [1] 物基因组测序降低到10万美元以下 。平地一声起惊雷，高速而廉价的测序技术，引起了所有人的震动，众 多高速测序技术开发公司纷纷走向前台，展开了激烈角逐，新一轮测序竞赛开始。在2006年，其竞争对手454 Life Sciences积极应战，研发出Genome Sequencer 20 向其叫板，更提出1000美金测序基因组的蓝图，一时 间热闹非凡。 454平台不但引领了测序方法的彻底性革命，而且还引导生物信息学技术向自动化的目标迈进。454平台 摒弃了传统的 “桑格法”测序，使用了纳米技术、微流体技术和微阵列技术，通过自动拼接短小DNA片断测 出了完整的基因组，速度为每小时600万个碱基。一个研究人员使用一台仪器就能在100天内轻松地完成30亿 [2] 对人类基因的排测。这是一个令人兴奋的DNA测序技术重大进展。 DNA高速测序技术的进步必将推动了整个基因组测序的进程。在2006年初露端倪后，在2007年，基因组 图谱成就非凡。不同物种的基因组测序与图谱层出不穷，种族化甚至个体化的基因组测序图谱也陆续开展。 [3] 不久前，人类的朋友猫和狗的基因组测序刚刚完成 ，又传来令国人兴奋的消息： “炎黄一号”的中国人基 [4] 因组测序图谱已经得到 。同种物种间不同种族的基因图谱描绘，正如火如荼地展开。更为瞩目的是个性化 [5] 基因测序真正实现，基因组学先锋人物Craig Venter成功测序了他个人的全基因组序列 。2007对于基因组学 的发展来说实在是热闹非凡的一年，而且相信在未来几年中，各种测序与图谱将陆续呈现，而个性化基因组 测序则积极推进SNP技术的发展，并进一步与疾病 人们继续探讨蛋白间相互作用与疾病之间的 诊断和治疗相结合，发挥更为强大的作用。基因组 关系，运用计算机辅助的方法研究蛋白结构以及与 图谱，作为生物信息学最为重要的基础，它的日益 其他蛋白的相互作用，成为揭示疾病的根源一种常 完善也必将进一步为信息分析提供更多的资源与便 用的手段。从蛋白的碱基到蛋白折叠乃至蛋白相互 利，促进生物信息学走向更高通量更自动化的广阔 作用网络结构，它们的变化与疾病的关系被一一剖 [8] 空间。 析。 2 . 蛋白组学初具成效 3. “小分子” RNA继续发热 基因组技术发展了，蛋白组相关技术并没有 除了基因组和蛋白组，近年来生物医学界 却步。近年来，质谱技术越来越多地被用于医学和