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2017-06-25 DOI: 10.3724/SP.J.1145.2016.07038 /
Chin J Appl Environ Biol 2017 23 ( 3 ) : 0459-0466
应用与环境生物学报 ，
皇竹草转录组分析揭示其抗冻特性*
1, 2 1 2 1 1**
颜 朗 吴燕 陈鼎 谭雪梅 张义正
1四川大学生命科学学院四川省分子生物学与生物技术重点实验室 成都 610064
2成都柯安科技有限公司 成都 610064
摘 要 皇竹草是一种高产、优质牧草，但因耐寒性较差而极大限制了其在我国大面积种植和推广. 选择在冬季平均温
5 5
度接近皇竹草耐寒极限温度的四川地区进行了 年自然驯化，筛选在最低温度- ℃下能够自然过冬的样本，并在冬季
最低温度下和夏季最高温度下分别取样进行转录组测序，挖掘皇竹草本身具有的耐寒、抗冻基因. 结果显示：皇竹草
125 467 65 633
转录组共有转录本 条，注释转录本 条，注释信息及邻近分析显示皇竹草与小米、玉米高度同源. 冬夏两季
皇竹草比较转录组分析共计筛选差异表达基因11 443个，其中冬季相对于夏季表达量上调基因6 943个，下调基因4 500
112 17
个，差异显著. 在以上差异表达基因中，共计挖掘在冬季低温条件下高度表达的抗冻基因 个，且有 个抗冻基因在
冬季样品中特异表达. 随机选取6个差异表达的抗冻基因进行荧光定量PCR实验验证，结果显示与预测转录本表达量
一致. 本研究对皇竹草进行了转录组测序并通过比较转录组的方法挖掘其在自然驯化条件下成功越冬样本中的抗冻
基因，有利于揭示皇竹草冷适应下的抗性机制，同时也有助于热带引种植物分子育种的开展. （图5 表4 参29）
关键词 皇竹草；转录组分析；抗冻基因；基因差异表达；功能聚类；低温胁迫应答
CLC S543.903.4
Transcriptome analysis reveals cold acclimation in Pennisetum sinese Roxb*
1, 2 1 2 1 1**
YAN Lang , WU Yan , CHEN Ding , TAN Xuemei ZHANG Yizheng
1
Sichuan Key Laboratory of Molecular Biology and Biotechnology, College of Life Sciences, Sichuan University, Chengdu 610064, China
2
Chengdu Ke’an Technology Ltd., Chengdu 610064, China
Abstract Pennisetum
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