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南方根结线虫延长因子2基因cdna全长克隆和序列分析-中国农学通报
中国农学通报 2011,27(01):223-228
Chinese Agricultural Science Bulletin
南方根结线虫延长因子2基因cDNA全长克隆和序列分析
黎娟华,赵平娟,孙海彦,彭明
(中国热带农业科学院热带生物技术研究所,海口571101)
摘 要:以南方根结线虫为材料,根据同源序列法分别进行3末端和5末端的RACE ,获得延长因子基因
2 cDNA 全长。此cDNA 全长序列为2434 bp ,包括2334 bp 的完整ORF ,编码一含777 个氨基酸的多
肽。该基因命名为Mi-eft2 ,其推导蛋白MI-EFT2 的编码氨基酸与秀丽隐杆线虫的Ce-eft 1,Ce-eft2 ,
Ce-eft3 ,Ce-eft4 基因的推导蛋白的同源性分别为26.7% 、86.9% 、13.8%和8.9% 。蛋白功能分类预测
MI-EFT2 是一种在蛋白质延长过程中起作用的GTP 水解酶,与真核生物的延长因子2 功能相同。
关键词:南方根结线虫;延长因子2 ;RACE ;蛋白功能预测
中图分类号:S432.45 文献标志码:A 论文编号:2010-2010
CloningandSequenceAnalysisofFull-lengthcDNAofElongationFactor2GeneofMeloidogyn
incognita
Li Juannhua, Zhao pingjuan, Sun haiyan, Peng Ming
(Institute of Tropical Bioscience and Biotechnology , Chinese Academy of Tropical Agricultural Sciences, Haikou 571101)
Abstract: The full-length cDNA sequence of elongation factor 2 (Mi-eft2) was obtained by RT-PCR and
RACE from Meloidogyne incognita. It consisted of 2434 nucleotides, and encoded 777 amino acids. The amino
acid sequence of deduced protein MI-EFT2 was 26.7%, 86.9 %, 13.8% and 8.9% identical with the deduced
proteins of Ce-eft 1, Ce-eft2, Ce-eft3 and Ce-eft4 from Caenorhabditis elegans respectively. Protein function
prediction of MI-EFT2 suggested that it was a GTPase just like the eukaryotic elongation factor EF2, involved
in the protein elongation process.
Keywords:Meloidogyne incognita; elongation factor 2; RACE; protein function prediction
[2-3]
0 引言 植物 。植物本身的抗线虫基因的研究和利用RNAi
南方根结线虫(Meloidogyne incognita)是重要的 技术研究线虫本身的基因,都是目前国内外较热的研
植物寄生线虫之一,寄主广泛,在中国特别是南方地区 究领域。利用基
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