叶酸代谢能力基因检测操作流程.docx

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MTHFR C677T , MTHFR A1298C,MTRR A66G基因检测操作流程实验流程一、操作步骤适用仪器:普通PCR仪样本要求:EDTA抗凝剂的静脉全血(100μl),室温保存不超过7天, 2~8℃保存不超过1个月,-20℃保存不超过3个月,反复冻融次数不超过5次;DNA的浓度应不低于5ng/μl, A260/ A 280应在1.6~2.0之间。有血块的样本需经匀浆处理或用组织研磨仪研磨处理后再进行全血DNA的提取。检验方法:(试剂盒中的检本测卡、阳性/阴性对照卡上标识解释如下:M表示突变型,WT表示野生型,C表示质控线,T表示检测线。)A: 样本DNA的制备试剂盒准备工作:1、清洗液BW-I:用50 ml量筒分别移取35 ml无水乙醇(分析纯)和35 ml异丙醇加入至清洗液BW-I试剂瓶中,颠倒混合均匀,在试剂瓶上标明“已加入醇”和日期,备用。2、清洗液BW-II:用50 ml量筒移取49 ml无水乙醇加入至清洗液BW-II试剂瓶中,颠倒混合均匀,在试剂瓶上标明“已加入醇”和日期,备用。3、蛋白酶K准备:取出蛋白酶K,室温解冻,涡旋混匀后备用。4、磁性微粒准备:将磁性微粒涡旋混匀,保证均一。实验操作步骤:将20 μl蛋白酶K溶液加入2 ml 离心管的管底。依次加入100 μl全血、200 μl裂解液BL,用涡旋振荡器混合15 sec(以下简称涡旋混匀),56 ℃水浴20 min。向步骤1裂解处理的样品中依次加入300 μl结合液BI、25 μl的磁性微粒(移取前必须充分涡旋混匀),涡旋混匀,室温静置5 min。磁性分离5 min,弃上清。从磁性分离器上取出离心管,加入400 μl清洗液BW-I,涡旋混匀,磁性分离至上清澄清(期间上下颠倒数次,以清洗离心管管壁),弃上清;重复本步操作,以400μl清洗液BW-I重复清洗一次。从磁性分离器上取出离心管,加入400 μl清洗液BW-II,涡旋混匀,磁性分离至上清澄清(期间上下颠倒数次,以清洗离心管管壁),弃上清(尽可能弃去所有的清洗液BW-II)。打开离心管盖,将其室温晾干5 min。从磁性分离器上取下离心管,向管中加入100 μl 洗脱液ES,涡旋混匀,56℃水浴5 min。将离心管置于磁性分离器上,磁性分离至上清澄清。将上清液(分离纯化得到的DNA溶液)转移到2 ml离心管中,直接用于下游实验或于-20 ℃保存备用。B:PCR扩增液准备(1)每人份需做两个反应,取两个无菌0.2ml PCR薄壁管,在PCR薄壁管管盖上依次标有M、WT。(2)将试剂从-20℃取出平衡至室温,瞬时离心。在标有M的管中加入29μl 扩增液(M),在标有WT的管中加入29 μl扩增液(WT)。 (3)分别向以上M和WT各管中加入1μl反应液。将管盖盖紧后,涡旋混匀,瞬时离心待用。C:待检测DNA样本的配制在上述标有M、WT管中分别加入3μl待测基因组DNA,分别再加入17μl ddH2O使终体积为50 μl。将管盖盖紧后,涡旋混匀,瞬时离心。D:PCR扩增将PCR管放入PCR仪中,按如下程序扩增:50℃ 2min;95℃ 5min; 94℃ 30sec、60℃ 30sec、 65℃ 1min(26Cycles);65℃ 10min; 4℃ Hold。取出PCR产物,2~8℃保存。E: 检测卡检测实验从密封袋中取出检测卡,将待测样本M与WT管中的PCR产物分别滴加在检测卡对应的样品垫处,待2~5 min对结果进行判读,20min后结果不可靠。F:质量控制(1)检测结果中阳性对照应在阳性对照卡检测线(T线)出条带,阴性对照应在阴性对照卡检测线(T线)不出条带。正常检测时,应定期进行阳性对照品及阴性对照品实验。(2)阳性对照品实验:取两个无菌0.2ml PCR薄壁管,在PCR薄壁管管盖上依次标有M、WT,将20μl M阳性对照液、20μl WT阳性对照液分别加入标有M、WT的PCR薄壁管中,再依次分别加入M扩增液29μl及1μl反应液、WT扩增液29μl及1μl反应液,按照步骤中D~F完成,检测线(T线)及质控线(C线)均应出现条带。(3)阴性对照品实验:取两个无菌0.2ml PCR薄壁管,在PCR薄壁管管盖上依次标有M、WT,将M扩增液29μl、1μl反应液及WT扩增液29μl、1μl反应液分别加入标有M、WT的PCR薄壁管中,再分别加入20μl阴性对照液,按照步骤中D~F完成,质控线(C线)应出现条带,检测线(T线)应无条带出现。G:结果判读(如下图、下表)如上图一所示,以阳性对照液为模板进行PCR反应,对PCR产物进行检测,检测线(T线)有条带出现,作为阳性对照;以阴性对照液为模板进行PCR反应,对PCR产物进行检测,检测线(T线)无条带出现,为阴性对照。若阴性样本有条带出现,有可能加

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